More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4526 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008758  Pnap_4526  acetate kinase  100 
 
 
593 aa  1217    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  53.69 
 
 
589 aa  610  1e-173  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6116  acetate kinase  51.61 
 
 
583 aa  551  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2921  acetate kinase  43.5 
 
 
772 aa  473  1e-132  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.602994 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2674  acetate kinase  54.19 
 
 
381 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  45.25 
 
 
398 aa  348  1e-94  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  45.06 
 
 
397 aa  343  5e-93  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  44.67 
 
 
398 aa  341  2e-92  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  42.18 
 
 
401 aa  335  1e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  43.75 
 
 
397 aa  333  5e-90  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  43.5 
 
 
397 aa  333  5e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  42.29 
 
 
399 aa  331  2e-89  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  48.28 
 
 
380 aa  331  3e-89  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  43.07 
 
 
397 aa  329  8e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  42.82 
 
 
397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  42.82 
 
 
397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  42.82 
 
 
397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  41.65 
 
 
399 aa  328  1.0000000000000001e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  43.83 
 
 
396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  42.82 
 
 
397 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  42.82 
 
 
397 aa  328  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  42.82 
 
 
397 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  45.8 
 
 
399 aa  327  4.0000000000000003e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  42.57 
 
 
397 aa  327  5e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  42.57 
 
 
397 aa  327  5e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  42.57 
 
 
397 aa  327  5e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  42.25 
 
 
396 aa  326  8.000000000000001e-88  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  42.08 
 
 
401 aa  324  3e-87  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  43.14 
 
 
404 aa  323  8e-87  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  43.89 
 
 
403 aa  322  9.000000000000001e-87  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  44.39 
 
 
406 aa  322  9.999999999999999e-87  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  43.64 
 
 
403 aa  322  1.9999999999999998e-86  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  42.18 
 
 
398 aa  321  3e-86  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  41.9 
 
 
406 aa  320  3.9999999999999996e-86  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  41.94 
 
 
398 aa  320  6e-86  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  44.89 
 
 
401 aa  318  1e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  42.86 
 
 
404 aa  318  2e-85  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  46.45 
 
 
422 aa  318  2e-85  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  42.51 
 
 
405 aa  317  4e-85  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  43.22 
 
 
400 aa  317  5e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  43.22 
 
 
400 aa  317  5e-85  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3937  acetate kinase  41.22 
 
 
404 aa  314  2.9999999999999996e-84  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.484081  normal  0.188518 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  41.35 
 
 
402 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  41.01 
 
 
395 aa  312  1e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2280  propionate kinase  44.3 
 
 
404 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.257687  decreased coverage  0.00259617 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2234  propionate kinase  44.3 
 
 
404 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2180  propionate kinase  44.3 
 
 
404 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2393  propionate kinase  44.3 
 
 
404 aa  312  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3887  acetate kinase  40.98 
 
 
404 aa  311  2e-83  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2227  propionate kinase  44.3 
 
 
404 aa  311  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.422778  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  39.25 
 
 
397 aa  310  4e-83  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  41.41 
 
 
398 aa  310  4e-83  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  41.41 
 
 
398 aa  309  8e-83  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  40.45 
 
 
397 aa  308  2.0000000000000002e-82  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  42 
 
 
397 aa  308  3e-82  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  40.48 
 
 
414 aa  307  3e-82  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  40.6 
 
 
397 aa  306  5.0000000000000004e-82  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3504  acetate kinase  41.18 
 
 
405 aa  306  8.000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  41.32 
 
 
408 aa  305  1.0000000000000001e-81  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  44.62 
 
 
401 aa  305  2.0000000000000002e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  42.96 
 
 
411 aa  304  3.0000000000000004e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  39.85 
 
 
397 aa  303  6.000000000000001e-81  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  40.2 
 
 
398 aa  302  1e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  41.46 
 
 
401 aa  301  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  40.91 
 
 
398 aa  301  3e-80  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  41.31 
 
 
417 aa  300  4e-80  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_34560  acetate kinase  44.94 
 
 
395 aa  300  4e-80  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.576649  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12210  acetate kinase  40.69 
 
 
399 aa  300  5e-80  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  40.15 
 
 
399 aa  300  6e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53470  acetate kinase  44.74 
 
 
394 aa  299  7e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00330068  hitchhiker  0.00786734 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  41.9 
 
 
396 aa  298  2e-79  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4684  acetate kinase  44.74 
 
 
394 aa  297  4e-79  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  38.86 
 
 
404 aa  297  4e-79  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  41.06 
 
 
397 aa  295  1e-78  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2207  acetate kinase  39.51 
 
 
408 aa  295  1e-78  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.297404 
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  39.15 
 
 
398 aa  295  2e-78  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  40.4 
 
 
400 aa  295  2e-78  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02238  acetate/propionate kinase  41.94 
 
 
393 aa  295  2e-78  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0920  acetate kinase  41.69 
 
 
414 aa  294  3e-78  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  41.88 
 
 
402 aa  294  3e-78  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  40.15 
 
 
399 aa  293  5e-78  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  39.9 
 
 
399 aa  293  7e-78  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  40.65 
 
 
421 aa  293  8e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  39.9 
 
 
399 aa  293  9e-78  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02942  acetate kinase  40.36 
 
 
398 aa  292  1e-77  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3044  acetate kinase  44.83 
 
 
386 aa  292  1e-77  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  40.25 
 
 
398 aa  291  2e-77  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  40.65 
 
 
398 aa  291  2e-77  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0557  acetate kinase  41.81 
 
 
420 aa  291  2e-77  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  41.16 
 
 
399 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  41.16 
 
 
399 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  41.16 
 
 
399 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  39.9 
 
 
399 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  39.9 
 
 
399 aa  291  2e-77  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  41.16 
 
 
399 aa  291  2e-77  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3528  acetate kinase  39.1 
 
 
394 aa  291  3e-77  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18649  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0052  acetate kinase  45.45 
 
 
395 aa  291  3e-77  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.737495 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  41.16 
 
 
413 aa  290  5.0000000000000004e-77  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  40.71 
 
 
396 aa  290  6e-77  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0692  acetate kinase  43.11 
 
 
395 aa  290  6e-77  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.302137  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>