More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Lreu_0560 on replicon NC_009513
Organism: Lactobacillus reuteri DSM 20016



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  100 
 
 		 398 aa  810    Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0469  acetate kinase  58 
 
 		 419 aa  516  1.0000000000000001e-145  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0464018  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1249  acetate kinase  56.39 
 
 		 397 aa  484  1e-135  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.407585  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1280  acetate kinase  54.81 
 
 		 418 aa  472  1e-132  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  56.85 
 
 		 396 aa  466  9.999999999999999e-131  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  56.35 
 
 		 397 aa  464  1e-129  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  56.35 
 
 		 397 aa  459  9.999999999999999e-129  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  55.58 
 
 		 397 aa  458  9.999999999999999e-129  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  56.6 
 
 		 397 aa  461  9.999999999999999e-129  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  55.58 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  55.58 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  55.58 
 
 		 397 aa  455  1e-127  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  55.58 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  56.09 
 
 		 397 aa  457  1e-127  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  55.58 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  55.58 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  55.58 
 
 		 397 aa  456  1e-127  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1269  acetate kinase  55.67 
 
 		 399 aa  442  1e-123  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1834  acetate kinase  53.65 
 
 		 397 aa  427  1e-118  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000432075  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  53.16 
 
 		 399 aa  426  1e-118  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2295  acetate kinase  53.02 
 
 		 395 aa  422  1e-117  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0168  acetate kinase  51.64 
 
 		 397 aa  415  9.999999999999999e-116  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.14758  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2294  acetate kinase  50.88 
 
 		 395 aa  413  1e-114  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  53.03 
 
 		 401 aa  410  1e-113  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  51 
 
 		 417 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  50.51 
 
 		 399 aa  406  1.0000000000000001e-112  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  48.27 
 
 		 397 aa  402  1e-111  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  49.75 
 
 		 397 aa  403  1e-111  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  50.13 
 
 		 397 aa  404  1e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  51.63 
 
 		 406 aa  399  9.999999999999999e-111  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  48.48 
 
 		 398 aa  401  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  49.24 
 
 		 398 aa  401  9.999999999999999e-111  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  52.01 
 
 		 406 aa  395  1e-109  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  50.88 
 
 		 403 aa  397  1e-109  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  51.52 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  51.52 
 
 		 400 aa  397  1e-109  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  47.68 
 
 		 398 aa  396  1e-109  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  47.94 
 
 		 398 aa  397  1e-109  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  51.13 
 
 		 403 aa  397  1e-109  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  48.98 
 
 		 397 aa  393  1e-108  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  48.22 
 
 		 405 aa  392  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2393  propionate kinase  46.68 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2280  propionate kinase  46.68 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.257687  decreased coverage  0.00259617 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  48.98 
 
 		 396 aa  391  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  48.26 
 
 		 397 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2180  propionate kinase  46.68 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2227  propionate kinase  46.94 
 
 		 404 aa  391  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.422778  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2234  propionate kinase  46.68 
 
 		 404 aa  389  1e-107  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  51.15 
 
 		 404 aa  387  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  51.9 
 
 		 401 aa  387  1e-106  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  48.37 
 
 		 399 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0431  acetate kinase  48.98 
 
 		 392 aa  386  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  47.21 
 
 		 395 aa  383  1e-105  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  48.73 
 
 		 398 aa  384  1e-105  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  48.98 
 
 		 408 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0940  acetate kinase  47.69 
 
 		 397 aa  379  1e-104  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000914313  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1733  acetate kinase  45.8 
 
 		 394 aa  369  1e-101  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  47.37 
 
 		 401 aa  371  1e-101  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0557  acetate kinase  46.82 
 
 		 420 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  48.98 
 
 		 398 aa  367  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  45.55 
 
 		 399 aa  365  1e-100  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  47.31 
 
 		 414 aa  364  1e-99  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  46.85 
 
 		 398 aa  363  2e-99  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  47.46 
 
 		 421 aa  363  3e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000122438  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12210  acetate kinase  47.59 
 
 		 399 aa  359  4e-98  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  48.22 
 
 		 401 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  45.94 
 
 		 421 aa  357  2.9999999999999997e-97  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  46.04 
 
 		 398 aa  357  2.9999999999999997e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  45.43 
 
 		 421 aa  354  1e-96  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  44.81 
 
 		 404 aa  353  2e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2277  acetate kinase  46.45 
 
 		 421 aa  354  2e-96  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000044561  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1946  acetate kinase  46.45 
 
 		 421 aa  354  2e-96  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0608  acetate kinase  45.43 
 
 		 421 aa  352  7e-96  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.387186  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  45.18 
 
 		 421 aa  352  8e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  46.08 
 
 		 396 aa  348  8e-95  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  44.53 
 
 		 402 aa  348  1e-94  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  46.45 
 
 		 402 aa  348  1e-94  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0230  acetate kinase  44.92 
 
 		 393 aa  347  2e-94  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl044  acetate kinase  46.35 
 
 		 396 aa  343  4e-93  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2230  acetate kinase  42.97 
 
 		 417 aa  343  4e-93  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.0000000835714  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0920  acetate kinase  43.65 
 
 		 414 aa  342  5e-93  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  44.28 
 
 		 404 aa  342  5e-93  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1162  acetate kinase  43 
 
 		 399 aa  342  8e-93  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  45.27 
 
 		 397 aa  340  2e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  44.14 
 
 		 421 aa  338  7e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  42.42 
 
 		 394 aa  338  9.999999999999999e-92  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  42.17 
 
 		 422 aa  336  3.9999999999999995e-91  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  43.26 
 
 		 402 aa  333  4e-90  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  44.25 
 
 		 397 aa  331  1e-89  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25160  acetate kinase  42.61 
 
 		 403 aa  332  1e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.748189  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  43.21 
 
 		 406 aa  330  2e-89  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  44.44 
 
 		 397 aa  330  2e-89  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0641  acetate kinase  42.11 
 
 		 405 aa  328  7e-89  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  hitchhiker  0.00773095  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  43.62 
 
 		 404 aa  328  7e-89  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1318  acetate kinase  42.46 
 
 		 396 aa  328  1.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  41.96 
 
 		 411 aa  328  1.0000000000000001e-88  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3311  acetate kinase  41.56 
 
 		 404 aa  328  1.0000000000000001e-88  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0788  acetate kinase  42.21 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.119296  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0712  acetate kinase  42.21 
 
 		 396 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  44.85 
 
 		 380 aa  327  2.0000000000000001e-88  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>