More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_2294 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008527  LACR_2294  acetate kinase  100 
 
 
395 aa  807    Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2295  acetate kinase  66.58 
 
 
395 aa  559  1e-158  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0168  acetate kinase  62.28 
 
 
397 aa  528  1e-149  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.14758  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1834  acetate kinase  61.27 
 
 
397 aa  531  1e-149  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000432075  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  56.63 
 
 
396 aa  457  1e-127  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  55.61 
 
 
397 aa  448  1e-125  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  53.06 
 
 
397 aa  431  1e-119  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0469  acetate kinase  52.02 
 
 
419 aa  430  1e-119  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0464018  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  53.06 
 
 
397 aa  424  1e-118  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  53.06 
 
 
397 aa  424  1e-118  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  53.06 
 
 
397 aa  424  1e-118  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  53.06 
 
 
397 aa  425  1e-118  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  53.06 
 
 
397 aa  426  1e-118  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  53.06 
 
 
397 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  53.06 
 
 
397 aa  424  1e-117  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  52.81 
 
 
397 aa  423  1e-117  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  53.06 
 
 
397 aa  424  1e-117  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  52.81 
 
 
397 aa  423  1e-117  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1275  acetate kinase  51.67 
 
 
417 aa  421  1e-116  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.419483  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1249  acetate kinase  52.01 
 
 
397 aa  418  1e-116  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.407585  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1280  acetate kinase  51.45 
 
 
418 aa  416  9.999999999999999e-116  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1767  acetate kinase  53.08 
 
 
400 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1802  acetate kinase  53.08 
 
 
400 aa  414  1e-114  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  51.52 
 
 
397 aa  412  1e-114  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  50.88 
 
 
398 aa  413  1e-114  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  51.77 
 
 
403 aa  409  1e-113  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  52.02 
 
 
403 aa  409  1e-113  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  51.65 
 
 
399 aa  408  1.0000000000000001e-112  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  50.77 
 
 
399 aa  405  1.0000000000000001e-112  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2280  propionate kinase  49.87 
 
 
404 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.257687  decreased coverage  0.00259617 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2180  propionate kinase  49.87 
 
 
404 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2234  propionate kinase  49.87 
 
 
404 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2227  propionate kinase  49.87 
 
 
404 aa  402  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.422778  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2393  propionate kinase  49.87 
 
 
404 aa  403  1e-111  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  51.02 
 
 
399 aa  398  9.999999999999999e-111  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  49.49 
 
 
398 aa  395  1e-109  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  47.85 
 
 
397 aa  389  1e-107  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  48.21 
 
 
397 aa  385  1e-106  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  48.47 
 
 
396 aa  387  1e-106  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1105  acetate kinase  49.24 
 
 
398 aa  385  1e-106  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000219398  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1269  acetate kinase  46.94 
 
 
399 aa  387  1e-106  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  49.11 
 
 
401 aa  382  1e-105  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  49.87 
 
 
398 aa  384  1e-105  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  48.98 
 
 
408 aa  380  1e-104  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_06280  acetate kinase  48.98 
 
 
414 aa  380  1e-104  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.719404  normal  0.0196101 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  49.49 
 
 
406 aa  381  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  48.22 
 
 
397 aa  377  1e-103  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  48.1 
 
 
401 aa  377  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0940  acetate kinase  48.1 
 
 
397 aa  374  1e-102  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000914313  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  47.85 
 
 
406 aa  374  1e-102  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  47.7 
 
 
398 aa  373  1e-102  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  46.53 
 
 
404 aa  369  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  48.86 
 
 
401 aa  371  1e-101  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  47.58 
 
 
398 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  47.58 
 
 
398 aa  370  1e-101  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  47.72 
 
 
405 aa  365  1e-100  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  45.66 
 
 
397 aa  362  5.0000000000000005e-99  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  47.09 
 
 
404 aa  361  1e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  45.43 
 
 
395 aa  357  1.9999999999999998e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0431  acetate kinase  46.17 
 
 
392 aa  355  6.999999999999999e-97  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  44.13 
 
 
399 aa  355  7.999999999999999e-97  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  47.45 
 
 
398 aa  355  1e-96  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  45.55 
 
 
398 aa  352  5e-96  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2543  acetate kinase  45.69 
 
 
421 aa  347  2e-94  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.60205e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1733  acetate kinase  42.93 
 
 
394 aa  347  2e-94  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  45.5 
 
 
397 aa  347  2e-94  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2656  acetate kinase  45.48 
 
 
422 aa  345  6e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12210  acetate kinase  44.02 
 
 
399 aa  343  2e-93  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0640  acetate kinase  44.39 
 
 
394 aa  343  4e-93  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2707  acetate kinase  44.44 
 
 
421 aa  340  2.9999999999999998e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.405254  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  44.7 
 
 
397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1034  acetate kinase  44.19 
 
 
421 aa  339  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000252602  hitchhiker  0.00000192642 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1754  acetate kinase  42.93 
 
 
421 aa  337  2.9999999999999997e-91  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.00000122438  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  47.07 
 
 
398 aa  335  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0920  acetate kinase  43.99 
 
 
414 aa  334  2e-90  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3242  acetate kinase  44.92 
 
 
402 aa  331  1e-89  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.697897  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  43.69 
 
 
421 aa  331  1e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  45.55 
 
 
404 aa  330  2e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_25160  acetate kinase  43.43 
 
 
403 aa  330  3e-89  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.748189  normal  0.886241 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  43.88 
 
 
396 aa  329  4e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2277  acetate kinase  43.18 
 
 
421 aa  329  5.0000000000000004e-89  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0000044561  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1049  acetate kinase  45.09 
 
 
401 aa  329  5.0000000000000004e-89  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1180  acetate kinase  43.22 
 
 
414 aa  327  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1946  acetate kinase  42.93 
 
 
421 aa  327  2.0000000000000001e-88  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0296  acetate kinase  43.94 
 
 
403 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1034  acetate kinase  43.72 
 
 
402 aa  326  4.0000000000000003e-88  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00869824  normal  0.811028 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  45.13 
 
 
399 aa  325  6e-88  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0230  acetate kinase  41.65 
 
 
393 aa  325  1e-87  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0343  acetate kinase  44.44 
 
 
402 aa  325  1e-87  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.441374  normal  0.643205 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  44.87 
 
 
399 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  44.87 
 
 
399 aa  324  2e-87  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0557  acetate kinase  43.07 
 
 
420 aa  323  3e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  43.44 
 
 
398 aa  323  4e-87  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  42.96 
 
 
406 aa  322  5e-87  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  45.13 
 
 
413 aa  321  9.999999999999999e-87  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  44.36 
 
 
399 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  44.39 
 
 
400 aa  320  1.9999999999999998e-86  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1473  acetate kinase  41.52 
 
 
411 aa  320  1.9999999999999998e-86  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.206902 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  44.16 
 
 
400 aa  320  3.9999999999999996e-86  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1865  acetate kinase  42.39 
 
 
404 aa  320  3.9999999999999996e-86  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>