More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_3179 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_3470  acetate kinase  87.4 
 
 
392 aa  656    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.787409 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3179  acetate kinase  100 
 
 
392 aa  776    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0356  acetate kinase  60.36 
 
 
397 aa  469  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.172238  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  59.38 
 
 
392 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  59.38 
 
 
392 aa  456  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  58.87 
 
 
392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  58.87 
 
 
392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  59.13 
 
 
392 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  58.87 
 
 
392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  59.13 
 
 
392 aa  452  1.0000000000000001e-126  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  60.88 
 
 
397 aa  451  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  56.85 
 
 
408 aa  441  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  54.81 
 
 
401 aa  413  1e-114  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0386  acetate kinase  54.55 
 
 
401 aa  394  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2235  acetate kinase  47.44 
 
 
390 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  45.88 
 
 
400 aa  326  5e-88  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  45.41 
 
 
396 aa  319  6e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  44.81 
 
 
393 aa  312  6.999999999999999e-84  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  45.75 
 
 
398 aa  311  2e-83  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  46.51 
 
 
391 aa  310  2.9999999999999997e-83  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  46.02 
 
 
400 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  50.33 
 
 
403 aa  307  2.0000000000000002e-82  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  47.69 
 
 
390 aa  307  2.0000000000000002e-82  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  44.24 
 
 
392 aa  306  3e-82  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  44.56 
 
 
396 aa  306  4.0000000000000004e-82  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  46.34 
 
 
394 aa  306  6e-82  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  42.93 
 
 
408 aa  301  2e-80  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  45.52 
 
 
391 aa  300  2e-80  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  46.55 
 
 
402 aa  300  3e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  45.09 
 
 
405 aa  298  1e-79  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  43.86 
 
 
404 aa  296  5e-79  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  47.89 
 
 
396 aa  296  6e-79  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  42.93 
 
 
394 aa  295  8e-79  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  47.63 
 
 
396 aa  293  2e-78  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  42.53 
 
 
405 aa  292  6e-78  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  44.13 
 
 
1305 aa  291  1e-77  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  47.42 
 
 
394 aa  291  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  42.16 
 
 
392 aa  289  5.0000000000000004e-77  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  43.45 
 
 
407 aa  288  8e-77  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  43.26 
 
 
393 aa  288  8e-77  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  46.58 
 
 
396 aa  288  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  42.82 
 
 
397 aa  288  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  45.38 
 
 
400 aa  287  2e-76  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  45.57 
 
 
399 aa  288  2e-76  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  46.1 
 
 
411 aa  286  4e-76  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  41.48 
 
 
402 aa  284  2.0000000000000002e-75  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  42.01 
 
 
398 aa  284  2.0000000000000002e-75  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  41.09 
 
 
404 aa  283  4.0000000000000003e-75  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  44.3 
 
 
402 aa  281  1e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  43.11 
 
 
405 aa  281  1e-74  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  44.17 
 
 
407 aa  281  2e-74  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  43.78 
 
 
402 aa  280  3e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  44.16 
 
 
398 aa  279  7e-74  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  44.19 
 
 
389 aa  278  8e-74  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  44.33 
 
 
392 aa  276  5e-73  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  42.34 
 
 
401 aa  273  3e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  46.29 
 
 
402 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  46.29 
 
 
402 aa  273  3e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  44.85 
 
 
389 aa  271  2e-71  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  43.15 
 
 
400 aa  270  4e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  44.3 
 
 
395 aa  270  4e-71  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  41.46 
 
 
416 aa  270  5e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3252  acetate kinase  43.32 
 
 
403 aa  268  1e-70  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.770051  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  42.04 
 
 
393 aa  268  1e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  45.2 
 
 
1230 aa  268  1e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  43.07 
 
 
400 aa  265  7e-70  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  42.67 
 
 
401 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2975  acetate kinase  42.49 
 
 
391 aa  265  1e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.409912  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  43.04 
 
 
389 aa  265  1e-69  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  41.77 
 
 
371 aa  264  2e-69  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  45.11 
 
 
1230 aa  264  2e-69  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  44.22 
 
 
1228 aa  261  1e-68  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0560  acetate kinase  40.55 
 
 
413 aa  260  2e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.844026 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  43.38 
 
 
382 aa  259  4e-68  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  43.38 
 
 
371 aa  260  4e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  47.52 
 
 
385 aa  256  5e-67  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  41.52 
 
 
410 aa  256  6e-67  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  40 
 
 
412 aa  255  9e-67  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2188  acetate kinase  39.31 
 
 
372 aa  254  3e-66  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  42.04 
 
 
404 aa  252  1e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  39.51 
 
 
589 aa  248  1e-64  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  39.23 
 
 
396 aa  246  6e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2716  acetate kinase  40.15 
 
 
408 aa  245  8e-64  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  42.64 
 
 
399 aa  245  9e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  36.25 
 
 
399 aa  245  9.999999999999999e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  37.31 
 
 
398 aa  244  1.9999999999999999e-63  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  39.51 
 
 
402 aa  243  3.9999999999999997e-63  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  43.22 
 
 
399 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  37.34 
 
 
396 aa  243  5e-63  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  37.6 
 
 
393 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  35.59 
 
 
398 aa  241  1e-62  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  37.6 
 
 
393 aa  241  1e-62  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  34.16 
 
 
404 aa  241  2e-62  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  35.98 
 
 
401 aa  240  2.9999999999999997e-62  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  40.84 
 
 
398 aa  240  2.9999999999999997e-62  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2216  acetate kinase  39.02 
 
 
372 aa  239  5e-62  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4208  acetate kinase  42.24 
 
 
367 aa  237  3e-61  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.804808  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  34.64 
 
 
401 aa  234  1.0000000000000001e-60  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2760  acetate kinase  36.82 
 
 
402 aa  235  1.0000000000000001e-60  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.819841  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  35 
 
 
399 aa  233  4.0000000000000004e-60  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>