More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_2716 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_2716  acetate kinase  100 
 
 
408 aa  824    Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0933  acetate kinase  40.65 
 
 
397 aa  310  2e-83  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.666104  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10210  acetate kinase  41.04 
 
 
398 aa  309  4e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000154307  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  39.5 
 
 
404 aa  309  5e-83  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0760  acetate kinase  40.15 
 
 
406 aa  304  1.0000000000000001e-81  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3826  acetate kinase  39.39 
 
 
399 aa  303  5.000000000000001e-81  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000259685  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0270  acetate kinase  39.85 
 
 
396 aa  301  1e-80  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0938  acetate kinase  37.68 
 
 
405 aa  300  2e-80  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.0000904206  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2136  acetate kinase  39.7 
 
 
397 aa  300  3e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.0000000219259  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1977  acetate kinase  39.4 
 
 
398 aa  297  2e-79  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0647  acetate kinase  38.75 
 
 
401 aa  297  2e-79  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2544  acetate kinase  46.27 
 
 
373 aa  295  7e-79  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1695  acetate kinase  38.9 
 
 
398 aa  295  7e-79  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0395303  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1170  acetate kinase  39.29 
 
 
397 aa  294  2e-78  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.185662 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1493  acetate kinase  38.86 
 
 
399 aa  293  3e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0874579  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0650  acetate kinase  38.96 
 
 
403 aa  293  5e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.276735  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0674  acetate kinase  39.05 
 
 
403 aa  293  5e-78  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0731  acetate kinase  40.3 
 
 
396 aa  291  1e-77  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3310  acetate kinase  39.55 
 
 
397 aa  291  1e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.865638  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2708  acetate kinase  39.8 
 
 
397 aa  290  2e-77  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0186296  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1028  acetate kinase  37.59 
 
 
399 aa  290  3e-77  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000413101  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1271  acetate kinase  38.22 
 
 
406 aa  289  5.0000000000000004e-77  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12210  acetate kinase  40.5 
 
 
399 aa  288  1e-76  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1731  acetate kinase  39.4 
 
 
401 aa  288  1e-76  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000422881  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0732  acetate kinase  37.78 
 
 
401 aa  288  1e-76  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000188256  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4468  acetate kinase  39.25 
 
 
397 aa  286  2.9999999999999996e-76  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0992  acetate kinase  45.37 
 
 
376 aa  286  4e-76  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4746  acetate kinase  39.25 
 
 
397 aa  285  7e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4773  acetate kinase  39 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4535  acetate kinase  39 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4371  acetate kinase  39 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4381  acetate kinase  39 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4888  acetate kinase  39 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4772  acetate kinase  39 
 
 
397 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0489  acetate kinase  39 
 
 
397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4755  acetate kinase  39 
 
 
397 aa  284  2.0000000000000002e-75  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1044  acetate kinase  41.34 
 
 
404 aa  283  3.0000000000000004e-75  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1948  acetate kinase  40.29 
 
 
589 aa  283  6.000000000000001e-75  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1820  acetate kinase  39.07 
 
 
408 aa  281  1e-74  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  unclonable  0.00000000179563  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0580  acetate kinase  41.54 
 
 
399 aa  278  1e-73  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0621  acetate kinase  37.78 
 
 
397 aa  278  2e-73  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.000000298382  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0469  acetate kinase  39.24 
 
 
419 aa  277  2e-73  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0464018  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2915  acetate kinase  39.01 
 
 
399 aa  277  3e-73  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1081  acetate kinase  37.22 
 
 
398 aa  276  4e-73  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.347293 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3099  acetate kinase  39 
 
 
398 aa  276  4e-73  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.492017  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2886  acetate kinase  38.52 
 
 
398 aa  276  5e-73  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00530496  decreased coverage  0.000000557586 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2303  acetate kinase  36.57 
 
 
398 aa  276  5e-73  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0797  acetate kinase  36.27 
 
 
406 aa  276  6e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1729  acetate kinase  39.1 
 
 
404 aa  275  8e-73  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.247984  normal  0.031096 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0655  acetate kinase  36.93 
 
 
397 aa  275  1.0000000000000001e-72  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000414678  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0208  acetate kinase  36.87 
 
 
398 aa  275  1.0000000000000001e-72  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.777111  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0528  acetate kinase  41.9 
 
 
399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2381  acetate kinase  38.52 
 
 
400 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.441751  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0538  acetate kinase  41.9 
 
 
399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  42.82 
 
 
397 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1552  acetate kinase  38.77 
 
 
399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.357591  normal  0.201508 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0550  acetate kinase  41.9 
 
 
399 aa  274  2.0000000000000002e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0104  acetate kinase  38.15 
 
 
397 aa  273  3e-72  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.66342  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1491  acetate kinase  38.77 
 
 
399 aa  274  3e-72  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000140767  normal  0.637827 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1558  acetate kinase  38.77 
 
 
399 aa  274  3e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.115014  normal  0.14682 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  38.1 
 
 
398 aa  273  4.0000000000000004e-72  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28510  acetate kinase  38.94 
 
 
409 aa  273  4.0000000000000004e-72  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.170304 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0940  acetate kinase  40.25 
 
 
397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000914313  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  38.71 
 
 
408 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0768  hypothetical protein  35.7 
 
 
397 aa  273  4.0000000000000004e-72  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00000329459  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2590  acetate kinase  38.6 
 
 
398 aa  273  5.000000000000001e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.871913  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3088  acetate kinase  39.34 
 
 
425 aa  272  6e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.273293  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2983  acetate kinase  39.34 
 
 
425 aa  272  7e-72  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.37833  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2897  acetate kinase  39.65 
 
 
415 aa  272  9e-72  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2409  acetate kinase  39.01 
 
 
413 aa  271  1e-71  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1705  acetate kinase  38.52 
 
 
399 aa  271  2e-71  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0458561  hitchhiker  0.00694718 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1327  acetate kinase  35.53 
 
 
395 aa  271  2e-71  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000000237028  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  40.74 
 
 
394 aa  270  2e-71  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2094  acetate kinase  36.57 
 
 
396 aa  270  2.9999999999999997e-71  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.202146  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10414  acetate kinase  41.54 
 
 
385 aa  269  5e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0206  acetate kinase  35.53 
 
 
398 aa  269  5.9999999999999995e-71  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  39.34 
 
 
380 aa  269  7e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11270  acetate kinase  41.27 
 
 
395 aa  269  7e-71  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0595808  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2693  acetate kinase  38.27 
 
 
399 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000276936  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2674  acetate kinase  38.27 
 
 
399 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00368662  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2772  acetate kinase  38.27 
 
 
399 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.170016  normal  0.900163 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1691  acetate kinase  38.27 
 
 
399 aa  268  8.999999999999999e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00532421  hitchhiker  0.00624387 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0812  acetate kinase  37.35 
 
 
399 aa  268  1e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1495  acetate kinase  38.4 
 
 
399 aa  268  1e-70  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3539  acetate kinase  38.35 
 
 
398 aa  267  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2578  acetate kinase  40.86 
 
 
408 aa  267  2e-70  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.406613  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2476  acetate kinase  38.77 
 
 
400 aa  266  5e-70  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  43.52 
 
 
1230 aa  265  8.999999999999999e-70  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3396  acetate kinase  35.32 
 
 
421 aa  265  1e-69  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000741189  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0490  acetate kinase  37.35 
 
 
405 aa  263  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.803694  normal  0.287149 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  39.8 
 
 
394 aa  263  6e-69  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  39.13 
 
 
398 aa  263  6e-69  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0077  acetate kinase  36.41 
 
 
397 aa  262  8.999999999999999e-69  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0557  acetate kinase  36.71 
 
 
420 aa  262  8.999999999999999e-69  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  40.35 
 
 
396 aa  262  8.999999999999999e-69  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1133  acetate kinase  39.12 
 
 
401 aa  262  8.999999999999999e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1733  acetate kinase  36.68 
 
 
394 aa  261  1e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2953  acetate kinase  40.25 
 
 
402 aa  261  1e-68  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.845819  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0560  acetate kinase  35.91 
 
 
398 aa  261  2e-68  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0701  acetate kinase  40.66 
 
 
389 aa  261  2e-68  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.019228 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>