More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tbd_0832 on replicon NC_007404
Organism: Thiobacillus denitrificans ATCC 25259



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007404  Tbd_0832  acetate kinase  100 
 
 		 363 aa  714    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.102932  normal  0.222032 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1467  acetate kinase  44.5 
 
 		 402 aa  271  2e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3806  acetate kinase  45.03 
 
 		 394 aa  268  1e-70  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.449542  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2692  acetate kinase  52.49 
 
 		 396 aa  265  8.999999999999999e-70  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1254  acetate kinase  52.04 
 
 		 396 aa  265  1e-69  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2914  acetate kinase  52.04 
 
 		 396 aa  264  2e-69  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0199  acetate kinase  40.8 
 
 		 408 aa  253  4.0000000000000004e-66  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.111809  normal  0.353737 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2060  acetate kinase  43.62 
 
 		 390 aa  251  1e-65  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0534  acetate kinase  43.72 
 
 		 405 aa  251  2e-65  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2706  acetate kinase  42.42 
 
 		 398 aa  250  3e-65  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_44030  acetate kinase  46.81 
 
 		 394 aa  249  4e-65  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0563  acetate kinase  43.69 
 
 		 400 aa  248  8e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6386  acetate kinase  40 
 
 		 394 aa  247  2e-64  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1621  acetate kinase  40.48 
 
 		 393 aa  246  4e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.880699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1915  acetate kinase  39.74 
 
 		 399 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.305645  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1589  acetate kinase  49.06 
 
 		 394 aa  245  8e-64  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1523  acetate kinase  41.13 
 
 		 396 aa  245  8e-64  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4653  acetate kinase  38.42 
 
 		 408 aa  245  9e-64  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.350055  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5046  acetate kinase  41.06 
 
 		 398 aa  244  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5745  acetate kinase  44.48 
 
 		 392 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.466778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2189  acetate kinase  42.46 
 
 		 397 aa  244  1.9999999999999999e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0741  acetate kinase  41.99 
 
 		 395 aa  243  3e-63  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.660011 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2138  putative phosphoketolase  43.78 
 
 		 1305 aa  243  3e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0981949  normal  0.111283 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1128  acetate kinase  41.96 
 
 		 401 aa  243  5e-63  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.323074 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0865  acetate kinase  42.67 
 
 		 404 aa  242  7.999999999999999e-63  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0625  acetate kinase  40.94 
 
 		 407 aa  240  2e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2377  acetate kinase  40.55 
 
 		 393 aa  239  5.999999999999999e-62  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000961127 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2655  acetate kinase  40.82 
 
 		 405 aa  239  6.999999999999999e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1203  acetate kinase  39.49 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1568  acetate kinase  43.29 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.489684  normal  0.769699 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5415  acetate kinase  42.61 
 
 		 402 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0562  acetate kinase  40.15 
 
 		 405 aa  238  1e-61  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7294  acetate kinase  41.56 
 
 		 396 aa  238  1e-61  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.975242  normal  0.796012 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0498  acetate kinase  42.68 
 
 		 400 aa  238  1e-61  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3225  acetate kinase  44.82 
 
 		 1230 aa  236  3e-61  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1954  acetate kinase  39.53 
 
 		 400 aa  237  3e-61  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.151784  normal  0.354384 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2099  acetate kinase  40.45 
 
 		 403 aa  236  6e-61  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1810  acetate kinase  40.56 
 
 		 394 aa  234  1.0000000000000001e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1060  acetate kinase  41.34 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2656  acetate kinase  41.34 
 
 		 392 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.508707  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3686  acetate kinase  42.42 
 
 		 393 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.320417  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1325  acetate kinase  40.82 
 
 		 397 aa  233  4.0000000000000004e-60  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3569  acetate kinase  45.32 
 
 		 411 aa  233  4.0000000000000004e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2799  acetate kinase  40.98 
 
 		 392 aa  233  4.0000000000000004e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0334  acetate kinase  37.56 
 
 		 401 aa  232  7.000000000000001e-60  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0120  acetate kinase  40.98 
 
 		 392 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.188552  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0144  acetate kinase  40.98 
 
 		 392 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1285  acetate kinase  40.98 
 
 		 392 aa  231  1e-59  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4675  acetate kinase  41.16 
 
 		 391 aa  231  2e-59  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0275467 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3608  acetate kinase  42.66 
 
 		 398 aa  229  4e-59  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.880493  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2798  acetate kinase  52.79 
 
 		 416 aa  229  7e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00189465 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0754  acetate kinase  40.83 
 
 		 410 aa  228  1e-58  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.433474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1346  acetate kinase  43.63 
 
 		 388 aa  228  1e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0429911  normal  0.010894 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5272  acetate kinase  43.43 
 
 		 386 aa  227  2e-58  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.666429 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1027  acetate kinase  41.37 
 
 		 400 aa  228  2e-58  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.529199  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3453  acetate kinase  39.69 
 
 		 412 aa  227  2e-58  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.698429 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3179  acetate kinase  42.56 
 
 		 392 aa  227  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.233297  normal  0.133275 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0416  acetate kinase  40.83 
 
 		 392 aa  227  3e-58  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0974  acetate kinase  40 
 
 		 393 aa  226  4e-58  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.724455  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3310  putative phosphoketolase  44.56 
 
 		 1230 aa  226  5.0000000000000005e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6098  acetate kinase  43.62 
 
 		 389 aa  226  6e-58  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705419 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1823  acetate kinase  41.75 
 
 		 399 aa  224  2e-57  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2633  acetate kinase  38.66 
 
 		 392 aa  224  2e-57  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0632  acetate kinase  42.11 
 
 		 382 aa  224  2e-57  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.214656  normal  1 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4372  acetate kinase  38.94 
 
 		 412 aa  224  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.920791  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3116  acetate kinase  44.64 
 
 		 1228 aa  223  4e-57  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.550572  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1669  propionate kinase  43.99 
 
 		 407 aa  221  9.999999999999999e-57  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.575965  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0051  acetate kinase  39.79 
 
 		 397 aa  221  9.999999999999999e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.942272  normal  0.0351432 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2978  acetate kinase  38 
 
 		 404 aa  221  9.999999999999999e-57  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.158659 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3470  acetate kinase  41.43 
 
 		 392 aa  221  9.999999999999999e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.787409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0422  acetate kinase  42.19 
 
 		 371 aa  221  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0372136  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1936  acetate kinase  33.67 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5898  acetate kinase  50.18 
 
 		 404 aa  221  1.9999999999999999e-56  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.239661 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6909  acetate kinase  46.65 
 
 		 401 aa  219  3.9999999999999997e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3495  acetate kinase  42.36 
 
 		 402 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4871  acetate kinase  42.36 
 
 		 402 aa  219  5e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0386  acetate kinase  37.56 
 
 		 401 aa  219  6e-56  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3816  acetate kinase  47.64 
 
 		 399 aa  219  6e-56  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.756648  normal  0.604346 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3824  acetate kinase  46.45 
 
 		 385 aa  219  7e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0408  acetate kinase  42.31 
 
 		 389 aa  219  7e-56  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0750002  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6196  acetate kinase  40.41 
 
 		 380 aa  218  1e-55  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4284  acetate kinase  46.82 
 
 		 399 aa  217  2e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.155669 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2227  propionate kinase  41.12 
 
 		 404 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.422778  normal  0.198158 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2393  propionate kinase  41.12 
 
 		 404 aa  217  2e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1158  acetate kinase  34.02 
 
 		 398 aa  217  2e-55  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00331056  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1295  acetate kinase  41.07 
 
 		 402 aa  216  2.9999999999999998e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2234  propionate kinase  41.12 
 
 		 404 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2180  propionate kinase  41.12 
 
 		 404 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1895  acetate kinase  37.76 
 
 		 391 aa  216  4e-55  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2280  propionate kinase  41.12 
 
 		 404 aa  216  4e-55  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.257687  decreased coverage  0.00259617 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4216  acetate kinase  41.13 
 
 		 389 aa  216  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  decreased coverage  0.00713648  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2610  acetate kinase  41.48 
 
 		 371 aa  215  9e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.328672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1295  acetate kinase  37.6 
 
 		 402 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.317937  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7535  acetate kinase  41.94 
 
 		 381 aa  214  2.9999999999999995e-54  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.315075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0053  acetate kinase  40.78 
 
 		 402 aa  214  2.9999999999999995e-54  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3055  acetate kinase  40.31 
 
 		 392 aa  211  1e-53  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4317  acetate kinase  37.92 
 
 		 393 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.113396 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4427  acetate kinase  37.92 
 
 		 393 aa  209  6e-53  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.209023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6116  acetate kinase  38.92 
 
 		 583 aa  209  7e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4526  acetate kinase  37.53 
 
 		 593 aa  209  7e-53  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>