36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PP_2462 on replicon NC_002947
Organism: Pseudomonas putida KT2440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2462  hypothetical protein  100 
 
 		 124 aa  248  2e-65  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3484  hypothetical protein  91.51 
 
 		 106 aa  174  5e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597105  normal  0.0535381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1964  hypothetical protein  90.57 
 
 		 106 aa  172  9e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000240343  normal  0.0241485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3228  hypothetical protein  97.17 
 
 		 106 aa  153  7e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.922801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1928  hypothetical protein  55.45 
 
 		 105 aa  113  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00532973  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2375  lipoprotein, putative  51.79 
 
 		 111 aa  103  6e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2159  putative lipoprotein  51.75 
 
 		 113 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0219297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2628  hypothetical protein  44.34 
 
 		 115 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1343  hypothetical protein  49.37 
 
 		 107 aa  81.6  0.000000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39070  hypothetical protein  48.53 
 
 		 130 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0920  hypothetical protein  41.58 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0156018 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0855  hypothetical protein  40.59 
 
 		 110 aa  73.2  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3576  hypothetical protein  42.55 
 
 		 111 aa  70.9  0.000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.395112  normal  0.317059 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3327  hypothetical protein  46.15 
 
 		 108 aa  65.5  0.0000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.23489  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2942  hypothetical protein  30.85 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4154  hypothetical protein  41.54 
 
 		 115 aa  62.4  0.000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2034  hypothetical protein  40.86 
 
 		 116 aa  62  0.000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4579  hypothetical protein  34.44 
 
 		 101 aa  59.7  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01900  hypothetical protein  40.66 
 
 		 87 aa  58.2  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0065  hypothetical protein  38.81 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1276  hypothetical protein  48.48 
 
 		 106 aa  55.5  0.0000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03320  hypothetical protein  38.81 
 
 		 111 aa  55.1  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0897  hypothetical protein  33.9 
 
 		 125 aa  53.1  0.000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0214  hypothetical protein  35.53 
 
 		 180 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0078  lipoprotein, putative  31 
 
 		 104 aa  49.7  0.00001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.473442 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0857  hypothetical protein  29.33 
 
 		 101 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.346144  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1229  hypothetical protein  33.62 
 
 		 111 aa  48.5  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297619  normal  0.401859 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3051  hypothetical protein  32.31 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2899  hypothetical protein  32.53 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30276  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6001  hypothetical protein  37.25 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.748226  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01278  conserved hypothetical protein  45.24 
 
 		 114 aa  42.4  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.485673  normal  0.0564995 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0109  hypothetical protein  37.25 
 
 		 90 aa  42.4  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851335 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2357  hypothetical protein  26.67 
 
 		 98 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15841  normal  0.507342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0213  hypothetical protein  29.06 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0122  hypothetical protein  41.86 
 
 		 120 aa  41.2  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.177303  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2264  hypothetical protein  32.73 
 
 		 119 aa  40.4  0.008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>