34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1964 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1964  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  214  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000240343  normal  0.0241485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3484  hypothetical protein  89.62 
 
 		 106 aa  173  6e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597105  normal  0.0535381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2462  hypothetical protein  90.57 
 
 		 124 aa  150  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3228  hypothetical protein  91.51 
 
 		 106 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.922801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1928  hypothetical protein  57.43 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00532973  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2375  lipoprotein, putative  56.76 
 
 		 111 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2159  putative lipoprotein  56.64 
 
 		 113 aa  107  5e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0219297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2628  hypothetical protein  46.3 
 
 		 115 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1343  hypothetical protein  47.44 
 
 		 107 aa  82  0.000000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0920  hypothetical protein  44.23 
 
 		 110 aa  80.5  0.000000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0156018 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39070  hypothetical protein  38.78 
 
 		 130 aa  80.1  0.000000000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0855  hypothetical protein  41.44 
 
 		 110 aa  79.3  0.00000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3576  hypothetical protein  43.01 
 
 		 111 aa  74.3  0.0000000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.395112  normal  0.317059 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2034  hypothetical protein  41.05 
 
 		 116 aa  65.1  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4579  hypothetical protein  36.84 
 
 		 101 aa  64.3  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3327  hypothetical protein  47.06 
 
 		 108 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.23489  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4154  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01900  hypothetical protein  43.53 
 
 		 87 aa  57.8  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2942  hypothetical protein  28.43 
 
 		 103 aa  57.4  0.00000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03320  hypothetical protein  40.3 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0065  hypothetical protein  37.31 
 
 		 129 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1276  hypothetical protein  46.97 
 
 		 106 aa  53.9  0.0000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0857  hypothetical protein  29.33 
 
 		 101 aa  51.2  0.000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.346144  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0214  hypothetical protein  36 
 
 		 180 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0078  lipoprotein, putative  30.61 
 
 		 104 aa  48.9  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.473442 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3051  hypothetical protein  30.56 
 
 		 100 aa  48.1  0.00004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0897  hypothetical protein  31.25 
 
 		 125 aa  47  0.00008  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1229  hypothetical protein  27.18 
 
 		 111 aa  43.9  0.0007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297619  normal  0.401859 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6001  hypothetical protein  37.25 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.748226  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0109  hypothetical protein  37.25 
 
 		 90 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851335 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01278  conserved hypothetical protein  45.24 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.485673  normal  0.0564995 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2357  hypothetical protein  27.63 
 
 		 98 aa  42  0.003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15841  normal  0.507342 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2899  hypothetical protein  32.91 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30276  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0122  hypothetical protein  39.53 
 
 		 120 aa  40.4  0.008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.177303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>