14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rru_A0122 on replicon NC_007643
Organism: Rhodospirillum rubrum ATCC 11170



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007643  Rru_A0122  hypothetical protein  100 
 
 		 120 aa  233  5.0000000000000005e-61  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.177303  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01278  conserved hypothetical protein  28.21 
 
 		 114 aa  58.5  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.485673  normal  0.0564995 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2942  hypothetical protein  34.55 
 
 		 103 aa  47.8  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6001  hypothetical protein  37.18 
 
 		 90 aa  44.7  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.748226  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0214  hypothetical protein  52.94 
 
 		 180 aa  45.1  0.0004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0109  hypothetical protein  36.11 
 
 		 90 aa  44.7  0.0005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851335 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2899  hypothetical protein  51.16 
 
 		 90 aa  43.9  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30276  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2375  lipoprotein, putative  30.4 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2264  hypothetical protein  52.94 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0056  hypothetical protein  32.53 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.514076 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4579  hypothetical protein  47.06 
 
 		 101 aa  42.7  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2462  hypothetical protein  41.86 
 
 		 124 aa  40.8  0.006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3228  hypothetical protein  44.74 
 
 		 106 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.922801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1964  hypothetical protein  39.53 
 
 		 106 aa  40  0.01  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000240343  normal  0.0241485 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>