35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_4579 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_4579  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  202  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1928  hypothetical protein  40 
 
 		 105 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00532973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03320  hypothetical protein  46.97 
 
 		 111 aa  62.8  0.000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2375  lipoprotein, putative  33.68 
 
 		 111 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3576  hypothetical protein  41.05 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.395112  normal  0.317059 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1343  hypothetical protein  43.04 
 
 		 107 aa  60.5  0.000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0855  hypothetical protein  39.18 
 
 		 110 aa  60.5  0.000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3484  hypothetical protein  36.36 
 
 		 106 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597105  normal  0.0535381 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0920  hypothetical protein  39.18 
 
 		 110 aa  59.7  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0156018 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0078  lipoprotein, putative  43.08 
 
 		 104 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.473442 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1964  hypothetical protein  40 
 
 		 106 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000240343  normal  0.0241485 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0214  hypothetical protein  48.21 
 
 		 180 aa  58.2  0.00000004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2159  putative lipoprotein  36 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0219297  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2462  hypothetical protein  38.46 
 
 		 124 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3228  hypothetical protein  38.46 
 
 		 106 aa  54.7  0.0000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.922801 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2034  hypothetical protein  43.08 
 
 		 116 aa  53.5  0.0000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2628  hypothetical protein  34.95 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2942  hypothetical protein  35 
 
 		 103 aa  52.4  0.000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0065  hypothetical protein  41.43 
 
 		 129 aa  52.4  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0109  hypothetical protein  39.74 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851335 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39070  hypothetical protein  41.54 
 
 		 130 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6001  hypothetical protein  39.74 
 
 		 90 aa  51.2  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.748226  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1229  hypothetical protein  34.51 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297619  normal  0.401859 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0056  hypothetical protein  37.68 
 
 		 90 aa  49.3  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.514076 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4154  hypothetical protein  33.85 
 
 		 115 aa  48.5  0.00003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2899  hypothetical protein  38.6 
 
 		 90 aa  45.8  0.0002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30276  normal  0.0529839 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0213  hypothetical protein  33 
 
 		 145 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3051  hypothetical protein  36.84 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2264  hypothetical protein  32.11 
 
 		 119 aa  44.3  0.0005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0857  hypothetical protein  39.39 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.346144  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01900  hypothetical protein  38.71 
 
 		 87 aa  42.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0122  hypothetical protein  47.06 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.177303  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1276  hypothetical protein  52.78 
 
 		 106 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0043  hypothetical protein  31.37 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.790029  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3950  hypothetical protein  52.63 
 
 		 184 aa  40  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.652483  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>