34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_39070 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_39070  hypothetical protein  100 
 
 		 130 aa  261  3e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3327  hypothetical protein  87.83 
 
 		 108 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.23489  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1928  hypothetical protein  41.03 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00532973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1964  hypothetical protein  47.37 
 
 		 106 aa  84  6e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000240343  normal  0.0241485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3484  hypothetical protein  43.75 
 
 		 106 aa  81.3  0.000000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597105  normal  0.0535381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2462  hypothetical protein  48.53 
 
 		 124 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2628  hypothetical protein  41.96 
 
 		 115 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3228  hypothetical protein  47.76 
 
 		 106 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.922801 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0920  hypothetical protein  38.94 
 
 		 110 aa  75.5  0.0000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0156018 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0855  hypothetical protein  38.05 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2375  lipoprotein, putative  40.17 
 
 		 111 aa  69.7  0.00000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2159  putative lipoprotein  36.75 
 
 		 113 aa  67.4  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0219297  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01900  hypothetical protein  45.54 
 
 		 87 aa  65.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3576  hypothetical protein  37.76 
 
 		 111 aa  64.7  0.0000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.395112  normal  0.317059 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1343  hypothetical protein  44.29 
 
 		 107 aa  63.2  0.000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2942  hypothetical protein  37.14 
 
 		 103 aa  62  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03320  hypothetical protein  43.28 
 
 		 111 aa  62  0.000000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2034  hypothetical protein  40.24 
 
 		 116 aa  61.2  0.000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0065  hypothetical protein  41.79 
 
 		 129 aa  57.4  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4579  hypothetical protein  38.1 
 
 		 101 aa  55.8  0.0000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3051  hypothetical protein  37.8 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4154  hypothetical protein  38.46 
 
 		 115 aa  54.7  0.0000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0857  hypothetical protein  40.3 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.346144  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0078  lipoprotein, putative  37.96 
 
 		 104 aa  53.5  0.000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.473442 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0213  hypothetical protein  29.92 
 
 		 145 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0214  hypothetical protein  35.19 
 
 		 180 aa  45.4  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0056  hypothetical protein  36.92 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.514076 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2191  hypothetical protein  37.5 
 
 		 90 aa  41.6  0.003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.016528  hitchhiker  0.00000426243 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1230  hypothetical protein  31.34 
 
 		 118 aa  40.8  0.006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119331  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1276  hypothetical protein  40.91 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01278  conserved hypothetical protein  29.87 
 
 		 114 aa  40.4  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.485673  normal  0.0564995 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6001  hypothetical protein  35.38 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.748226  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0109  hypothetical protein  35.38 
 
 		 90 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851335 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2357  hypothetical protein  28.57 
 
 		 98 aa  40.4  0.009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15841  normal  0.507342 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>