33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_3484 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_3484  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  215  1e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597105  normal  0.0535381 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1964  hypothetical protein  89.62 
 
 		 106 aa  170  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000240343  normal  0.0241485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2462  hypothetical protein  91.51 
 
 		 124 aa  154  5.0000000000000005e-37  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3228  hypothetical protein  93.4 
 
 		 106 aa  148  2e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.922801 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1928  hypothetical protein  57.43 
 
 		 105 aa  110  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00532973  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2375  lipoprotein, putative  54.95 
 
 		 111 aa  108  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2159  putative lipoprotein  52.21 
 
 		 113 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0219297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2628  hypothetical protein  44.76 
 
 		 115 aa  82  0.000000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1343  hypothetical protein  51.39 
 
 		 107 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39070  hypothetical protein  47.06 
 
 		 130 aa  76.6  0.0000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0920  hypothetical protein  39.6 
 
 		 110 aa  73.6  0.0000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0156018 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0855  hypothetical protein  37.04 
 
 		 110 aa  71.6  0.000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3576  hypothetical protein  40.86 
 
 		 111 aa  68.2  0.00000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.395112  normal  0.317059 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4579  hypothetical protein  35.29 
 
 		 101 aa  62  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3327  hypothetical protein  47.06 
 
 		 108 aa  61.2  0.000000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.23489  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2034  hypothetical protein  40.86 
 
 		 116 aa  60.5  0.000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4154  hypothetical protein  40 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03320  hypothetical protein  40.3 
 
 		 111 aa  59.7  0.00000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0065  hypothetical protein  37.97 
 
 		 129 aa  58.9  0.00000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1276  hypothetical protein  48.48 
 
 		 106 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01900  hypothetical protein  40.66 
 
 		 87 aa  55.5  0.0000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2942  hypothetical protein  29.67 
 
 		 103 aa  54.7  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0214  hypothetical protein  37.33 
 
 		 180 aa  52  0.000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0857  hypothetical protein  28.95 
 
 		 101 aa  50.1  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.346144  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0078  lipoprotein, putative  32.31 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.473442 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2357  hypothetical protein  28.95 
 
 		 98 aa  45.4  0.0002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15841  normal  0.507342 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0897  hypothetical protein  31.25 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3051  hypothetical protein  30.56 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662958 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01278  conserved hypothetical protein  34.62 
 
 		 114 aa  43.9  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.485673  normal  0.0564995 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1229  hypothetical protein  33.62 
 
 		 111 aa  43.9  0.0008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297619  normal  0.401859 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6001  hypothetical protein  35.71 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.748226  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0109  hypothetical protein  35.71 
 
 		 90 aa  41.6  0.004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851335 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2899  hypothetical protein  33.8 
 
 		 90 aa  40.8  0.007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.30276  normal  0.0529839 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>