24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sala_3051 on replicon NC_008048
Organism: Sphingopyxis alaskensis RB2256



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008048  Sala_3051  hypothetical protein  100 
 
 		 100 aa  205  2e-52  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0857  hypothetical protein  56.34 
 
 		 101 aa  92  3e-18  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.346144  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2942  hypothetical protein  38.2 
 
 		 103 aa  63.2  0.000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1928  hypothetical protein  30.61 
 
 		 105 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00532973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39070  hypothetical protein  41.54 
 
 		 130 aa  52.8  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0078  lipoprotein, putative  34.34 
 
 		 104 aa  52.8  0.000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.473442 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1343  hypothetical protein  36.36 
 
 		 107 aa  52  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2159  putative lipoprotein  32.93 
 
 		 113 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0219297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3327  hypothetical protein  40.58 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.23489  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1964  hypothetical protein  30.56 
 
 		 106 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000240343  normal  0.0241485 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2628  hypothetical protein  32.29 
 
 		 115 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0065  hypothetical protein  34.72 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2191  hypothetical protein  39.36 
 
 		 90 aa  48.1  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.016528  hitchhiker  0.00000426243 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4579  hypothetical protein  34.38 
 
 		 101 aa  47  0.00008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2375  lipoprotein, putative  30.23 
 
 		 111 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3228  hypothetical protein  32.31 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.922801 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3484  hypothetical protein  30.56 
 
 		 106 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597105  normal  0.0535381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2462  hypothetical protein  32.31 
 
 		 124 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2034  hypothetical protein  35.53 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0920  hypothetical protein  37.5 
 
 		 110 aa  44.7  0.0004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0156018 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03320  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0855  hypothetical protein  37.5 
 
 		 110 aa  45.1  0.0004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2264  hypothetical protein  28.79 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0214  hypothetical protein  42.22 
 
 		 180 aa  40.4  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>