36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_03320 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010717  PXO_03320  hypothetical protein  100 
 
 		 111 aa  223  5.0000000000000005e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0065  hypothetical protein  64.86 
 
 		 129 aa  104  4e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0855  hypothetical protein  55 
 
 		 110 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0920  hypothetical protein  55 
 
 		 110 aa  83.6  8e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0156018 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2034  hypothetical protein  51.22 
 
 		 116 aa  73.9  0.0000000000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3576  hypothetical protein  48.75 
 
 		 111 aa  72.8  0.000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.395112  normal  0.317059 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2628  hypothetical protein  44.05 
 
 		 115 aa  70.5  0.000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1343  hypothetical protein  44.16 
 
 		 107 aa  67.8  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4154  hypothetical protein  46.15 
 
 		 115 aa  64.7  0.0000000005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4579  hypothetical protein  47.14 
 
 		 101 aa  63.9  0.0000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2375  lipoprotein, putative  33.33 
 
 		 111 aa  61.6  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1276  hypothetical protein  53.85 
 
 		 106 aa  60.8  0.000000007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39070  hypothetical protein  43.28 
 
 		 130 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1964  hypothetical protein  40.79 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000240343  normal  0.0241485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3484  hypothetical protein  40.3 
 
 		 106 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597105  normal  0.0535381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1928  hypothetical protein  38.81 
 
 		 105 aa  57.8  0.00000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00532973  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3228  hypothetical protein  38.81 
 
 		 106 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.922801 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2159  putative lipoprotein  34.94 
 
 		 113 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0219297  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2462  hypothetical protein  38.81 
 
 		 124 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2357  hypothetical protein  35.62 
 
 		 98 aa  50.4  0.000009  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15841  normal  0.507342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0214  hypothetical protein  43.33 
 
 		 180 aa  49.7  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3327  hypothetical protein  43.28 
 
 		 108 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.23489  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0078  lipoprotein, putative  32.31 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.473442 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0056  hypothetical protein  34.78 
 
 		 90 aa  45.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.514076 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3051  hypothetical protein  34.72 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662958 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01278  conserved hypothetical protein  29.9 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.485673  normal  0.0564995 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0109  hypothetical protein  36.23 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851335 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6001  hypothetical protein  36.23 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.748226  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1230  hypothetical protein  28.16 
 
 		 118 aa  44.3  0.0005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119331  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2942  hypothetical protein  29.41 
 
 		 103 aa  44.3  0.0006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2191  hypothetical protein  36.36 
 
 		 90 aa  43.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.016528  hitchhiker  0.00000426243 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0897  hypothetical protein  36.36 
 
 		 125 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01900  hypothetical protein  43.08 
 
 		 87 aa  42.4  0.002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0857  hypothetical protein  29.87 
 
 		 101 aa  41.2  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.346144  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0213  hypothetical protein  37.14 
 
 		 145 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1229  hypothetical protein  30.59 
 
 		 111 aa  40.4  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297619  normal  0.401859 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>