17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_0897 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_0897  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  246  7e-65  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0920  hypothetical protein  33.91 
 
 		 110 aa  60.1  0.00000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0156018 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0855  hypothetical protein  33.04 
 
 		 110 aa  58.5  0.00000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3576  hypothetical protein  40 
 
 		 111 aa  51.6  0.000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.395112  normal  0.317059 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2628  hypothetical protein  32.04 
 
 		 115 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3228  hypothetical protein  40 
 
 		 106 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.922801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2462  hypothetical protein  38.46 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1964  hypothetical protein  36.92 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000240343  normal  0.0241485 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1343  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  46.6  0.0001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2375  lipoprotein, putative  29.57 
 
 		 111 aa  45.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2034  hypothetical protein  37.31 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3484  hypothetical protein  36.92 
 
 		 106 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597105  normal  0.0535381 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03320  hypothetical protein  36.36 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1276  hypothetical protein  41.54 
 
 		 106 aa  45.4  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2159  putative lipoprotein  33.85 
 
 		 113 aa  44.3  0.0005  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0219297  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4154  hypothetical protein  36.92 
 
 		 115 aa  44.3  0.0006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1928  hypothetical protein  28.87 
 
 		 105 aa  43.9  0.0007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00532973  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>