26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_4154 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008786  Veis_4154  hypothetical protein  100 
 
 
115 aa  221  3e-57  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0855  hypothetical protein  55.77 
 
 
110 aa  103  1e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0920  hypothetical protein  54.13 
 
 
110 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0156018 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3576  hypothetical protein  59.26 
 
 
111 aa  101  3e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.395112  normal  0.317059 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2034  hypothetical protein  48.94 
 
 
116 aa  83.2  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1343  hypothetical protein  53.85 
 
 
107 aa  77.8  0.00000000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03320  hypothetical protein  46.27 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3228  hypothetical protein  43.28 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.922801 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1964  hypothetical protein  40.79 
 
 
106 aa  64.3  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000240343  normal  0.0241485 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2462  hypothetical protein  41.79 
 
 
124 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3484  hypothetical protein  37.78 
 
 
106 aa  63.5  0.0000000008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597105  normal  0.0535381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39070  hypothetical protein  37.11 
 
 
130 aa  62.8  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0065  hypothetical protein  37.84 
 
 
129 aa  56.2  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2159  putative lipoprotein  35.8 
 
 
113 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0219297  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1928  hypothetical protein  32.38 
 
 
105 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00532973  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2375  lipoprotein, putative  30 
 
 
111 aa  54.7  0.0000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2628  hypothetical protein  35 
 
 
115 aa  53.9  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2264  hypothetical protein  33.33 
 
 
119 aa  51.2  0.000005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0078  lipoprotein, putative  33 
 
 
104 aa  50.8  0.000007  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.473442 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3327  hypothetical protein  40.66 
 
 
108 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.23489  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0214  hypothetical protein  39.53 
 
 
180 aa  49.3  0.00002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0857  hypothetical protein  38.46 
 
 
101 aa  48.9  0.00003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.346144  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4579  hypothetical protein  33.8 
 
 
101 aa  48.1  0.00004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1276  hypothetical protein  43.08 
 
 
106 aa  47.8  0.00005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2942  hypothetical protein  31.73 
 
 
103 aa  47.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0897  hypothetical protein  36.92 
 
 
125 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>