23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_0857 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_0857  hypothetical protein  100 
 
 		 101 aa  197  3e-50  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.346144  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3051  hypothetical protein  50 
 
 		 100 aa  94.4  5e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1928  hypothetical protein  34.26 
 
 		 105 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00532973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2942  hypothetical protein  41.76 
 
 		 103 aa  62.4  0.000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3484  hypothetical protein  27.27 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597105  normal  0.0535381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39070  hypothetical protein  40.3 
 
 		 130 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1343  hypothetical protein  34.72 
 
 		 107 aa  52.4  0.000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2628  hypothetical protein  36.17 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1964  hypothetical protein  29.33 
 
 		 106 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000240343  normal  0.0241485 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2159  putative lipoprotein  31 
 
 		 113 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0219297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0855  hypothetical protein  31.73 
 
 		 110 aa  50.4  0.000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4579  hypothetical protein  36.84 
 
 		 101 aa  50.4  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2375  lipoprotein, putative  34.69 
 
 		 111 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3327  hypothetical protein  40.3 
 
 		 108 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.23489  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3228  hypothetical protein  29.85 
 
 		 106 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.922801 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0920  hypothetical protein  31.37 
 
 		 110 aa  49.7  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0156018 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2462  hypothetical protein  28.36 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0078  lipoprotein, putative  42.42 
 
 		 104 aa  47  0.00008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.473442 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2264  hypothetical protein  32.53 
 
 		 119 aa  46.2  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2191  hypothetical protein  30.43 
 
 		 90 aa  44.3  0.0006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.016528  hitchhiker  0.00000426243 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0065  hypothetical protein  30.43 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4154  hypothetical protein  36.36 
 
 		 115 aa  42  0.003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01900  hypothetical protein  30.34 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>