28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2628 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2628  hypothetical protein  100 
 
 		 115 aa  234  3e-61  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1928  hypothetical protein  47.92 
 
 		 105 aa  89  2e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00532973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3484  hypothetical protein  46.59 
 
 		 106 aa  77.4  0.00000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597105  normal  0.0535381 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2462  hypothetical protein  53.85 
 
 		 124 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1964  hypothetical protein  39.05 
 
 		 106 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000240343  normal  0.0241485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3228  hypothetical protein  53.85 
 
 		 106 aa  75.9  0.0000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.922801 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0855  hypothetical protein  43.16 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0920  hypothetical protein  43.16 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0156018 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01900  hypothetical protein  54.44 
 
 		 87 aa  74.3  0.0000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39070  hypothetical protein  49.23 
 
 		 130 aa  68.6  0.00000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03320  hypothetical protein  49.23 
 
 		 111 aa  67.4  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1343  hypothetical protein  42.11 
 
 		 107 aa  64.7  0.0000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2375  lipoprotein, putative  36.19 
 
 		 111 aa  63.9  0.0000000007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2034  hypothetical protein  43.37 
 
 		 116 aa  62  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0065  hypothetical protein  43.08 
 
 		 129 aa  59.7  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2942  hypothetical protein  34.78 
 
 		 103 aa  58.9  0.00000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2159  putative lipoprotein  40 
 
 		 113 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0219297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3327  hypothetical protein  49.23 
 
 		 108 aa  57  0.00000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.23489  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3576  hypothetical protein  37.23 
 
 		 111 aa  56.6  0.0000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.395112  normal  0.317059 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4579  hypothetical protein  34.95 
 
 		 101 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4154  hypothetical protein  38.46 
 
 		 115 aa  52.8  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0078  lipoprotein, putative  33.33 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.473442 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1276  hypothetical protein  44.62 
 
 		 106 aa  47  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0857  hypothetical protein  34.62 
 
 		 101 aa  46.2  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.346144  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0897  hypothetical protein  27.78 
 
 		 125 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3051  hypothetical protein  35.38 
 
 		 100 aa  45.4  0.0003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1229  hypothetical protein  30.91 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297619  normal  0.401859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0214  hypothetical protein  32.43 
 
 		 180 aa  40  0.01  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>