17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1229 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1229  hypothetical protein  100 
 
 
111 aa  226  1e-58  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297619  normal  0.401859 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0214  hypothetical protein  41.89 
 
 
180 aa  50.1  0.00001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4579  hypothetical protein  34.51 
 
 
101 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6001  hypothetical protein  37.88 
 
 
90 aa  44.3  0.0006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.748226  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0109  hypothetical protein  37.5 
 
 
90 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0851335 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0920  hypothetical protein  26.89 
 
 
110 aa  43.5  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0156018 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2942  hypothetical protein  38.46 
 
 
103 aa  43.5  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2628  hypothetical protein  30.91 
 
 
115 aa  43.5  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0078  lipoprotein, putative  30.63 
 
 
104 aa  43.1  0.001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.473442 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0855  hypothetical protein  26.05 
 
 
110 aa  43.5  0.001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0056  hypothetical protein  34.38 
 
 
90 aa  41.6  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.514076 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0042  hypothetical protein  33.33 
 
 
126 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1343  hypothetical protein  32.31 
 
 
107 aa  41.2  0.005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2264  hypothetical protein  47.37 
 
 
119 aa  40.8  0.007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1964  hypothetical protein  32.31 
 
 
106 aa  40.4  0.007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000240343  normal  0.0241485 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0213  hypothetical protein  32.43 
 
 
145 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2462  hypothetical protein  35.38 
 
 
124 aa  40  0.01  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>