22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2264 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2264  hypothetical protein  100 
 
 		 119 aa  240  5e-63  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0214  hypothetical protein  51.02 
 
 		 180 aa  59.7  0.00000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2942  hypothetical protein  33.94 
 
 		 103 aa  57  0.00000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3576  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  47.8  0.00006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.395112  normal  0.317059 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4154  hypothetical protein  38.18 
 
 		 115 aa  46.2  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0857  hypothetical protein  33.33 
 
 		 101 aa  45.8  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.346144  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2533  hypothetical protein  40.26 
 
 		 118 aa  45.1  0.0004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.322448  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6001  hypothetical protein  38.24 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.748226  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0056  hypothetical protein  38.24 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.514076 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0109  hypothetical protein  38.24 
 
 		 90 aa  45.1  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851335 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0855  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  44.3  0.0005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4579  hypothetical protein  32.11 
 
 		 101 aa  44.3  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0920  hypothetical protein  33.33 
 
 		 110 aa  44.3  0.0006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0156018 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3051  hypothetical protein  28.79 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0122  hypothetical protein  52.94 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.177303  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0213  hypothetical protein  35.53 
 
 		 145 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2034  hypothetical protein  29.85 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1928  hypothetical protein  30.26 
 
 		 105 aa  41.2  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00532973  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1229  hypothetical protein  47.37 
 
 		 111 aa  40.8  0.007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297619  normal  0.401859 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3228  hypothetical protein  32.73 
 
 		 106 aa  40.8  0.007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.922801 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0078  lipoprotein, putative  29.82 
 
 		 104 aa  40.4  0.008  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.473442 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2462  hypothetical protein  32.73 
 
 		 124 aa  40.4  0.008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>