36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Csal_2942 on replicon NC_007963
Organism: Chromohalobacter salexigens DSM 3043



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007963  Csal_2942  hypothetical protein  100 
 
 
103 aa  207  3e-53  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3051  hypothetical protein  37.21 
 
 
100 aa  59.7  0.00000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0078  lipoprotein, putative  39.18 
 
 
104 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.473442 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2628  hypothetical protein  34.78 
 
 
115 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2264  hypothetical protein  33.94 
 
 
119 aa  57  0.00000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0855  hypothetical protein  31.48 
 
 
110 aa  53.1  0.000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0920  hypothetical protein  31.48 
 
 
110 aa  52.8  0.000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0156018 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39070  hypothetical protein  40 
 
 
130 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4579  hypothetical protein  35 
 
 
101 aa  52.4  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01900  hypothetical protein  36.96 
 
 
87 aa  50.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1343  hypothetical protein  35.06 
 
 
107 aa  50.8  0.000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3484  hypothetical protein  28.41 
 
 
106 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597105  normal  0.0535381 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2159  putative lipoprotein  28.3 
 
 
113 aa  50.4  0.000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0219297  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3327  hypothetical protein  40 
 
 
108 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.23489  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2462  hypothetical protein  30.77 
 
 
124 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1928  hypothetical protein  24.27 
 
 
105 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00532973  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0857  hypothetical protein  39.74 
 
 
101 aa  49.3  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.346144  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2191  hypothetical protein  31.58 
 
 
90 aa  48.5  0.00003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.016528  hitchhiker  0.00000426243 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2375  lipoprotein, putative  26.92 
 
 
111 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0122  hypothetical protein  34.55 
 
 
120 aa  47.8  0.00006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.177303  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3228  hypothetical protein  30.77 
 
 
106 aa  47.8  0.00006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.922801 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0056  hypothetical protein  37.21 
 
 
90 aa  46.2  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.514076 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0214  hypothetical protein  42.42 
 
 
180 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0213  hypothetical protein  29.2 
 
 
145 aa  45.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1964  hypothetical protein  27.27 
 
 
106 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000240343  normal  0.0241485 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2034  hypothetical protein  32.18 
 
 
116 aa  45.1  0.0003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1229  hypothetical protein  38.46 
 
 
111 aa  43.5  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297619  normal  0.401859 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0109  hypothetical protein  40.3 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0851335 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_6001  hypothetical protein  40.3 
 
 
90 aa  42.7  0.002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.748226  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1230  hypothetical protein  34.33 
 
 
118 aa  42.7  0.002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119331  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0065  hypothetical protein  30.77 
 
 
129 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2622  hypothetical protein  32.43 
 
 
95 aa  42  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244467  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4154  hypothetical protein  30.1 
 
 
115 aa  41.2  0.004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01278  conserved hypothetical protein  33.33 
 
 
114 aa  41.2  0.005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.485673  normal  0.0564995 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3576  hypothetical protein  32.26 
 
 
111 aa  40.8  0.006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.395112  normal  0.317059 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03320  hypothetical protein  28.79 
 
 
111 aa  40  0.01  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>