23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_6001 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_6001  hypothetical protein  100 
 
 		 90 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.748226  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0109  hypothetical protein  98.89 
 
 		 90 aa  177  4.999999999999999e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0851335 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0056  hypothetical protein  84.44 
 
 		 90 aa  135  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.514076 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2622  hypothetical protein  44.26 
 
 		 95 aa  59.7  0.00000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244467  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2191  hypothetical protein  32.22 
 
 		 90 aa  53.9  0.0000006  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.016528  hitchhiker  0.00000426243 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4579  hypothetical protein  36 
 
 		 101 aa  53.1  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0214  hypothetical protein  48.21 
 
 		 180 aa  51.2  0.000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1230  hypothetical protein  38.89 
 
 		 118 aa  48.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119331  normal  0.387929 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0122  hypothetical protein  37.18 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.177303  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2264  hypothetical protein  38.24 
 
 		 119 aa  45.4  0.0002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3576  hypothetical protein  35.96 
 
 		 111 aa  46.2  0.0002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.395112  normal  0.317059 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2942  hypothetical protein  35.87 
 
 		 103 aa  45.1  0.0003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1229  hypothetical protein  37.88 
 
 		 111 aa  45.1  0.0003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0297619  normal  0.401859 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03320  hypothetical protein  36.36 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1964  hypothetical protein  38 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000240343  normal  0.0241485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3228  hypothetical protein  37.25 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.922801 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1343  hypothetical protein  33.33 
 
 		 107 aa  43.5  0.001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2375  lipoprotein, putative  35.71 
 
 		 111 aa  43.5  0.001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2462  hypothetical protein  37.25 
 
 		 124 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3484  hypothetical protein  35.71 
 
 		 106 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597105  normal  0.0535381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39070  hypothetical protein  35.38 
 
 		 130 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3327  hypothetical protein  33.85 
 
 		 108 aa  40.8  0.006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.23489  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0213  hypothetical protein  43.24 
 
 		 145 aa  40.8  0.007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>