30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2034 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_2034  hypothetical protein  100 
 
 		 116 aa  230  4.0000000000000004e-60  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0855  hypothetical protein  45.95 
 
 		 110 aa  83.6  9e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3576  hypothetical protein  46.46 
 
 		 111 aa  83.2  0.000000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.395112  normal  0.317059 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0920  hypothetical protein  45.05 
 
 		 110 aa  81.6  0.000000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0156018 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4154  hypothetical protein  56.06 
 
 		 115 aa  79.3  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1343  hypothetical protein  51.32 
 
 		 107 aa  71.6  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03320  hypothetical protein  55.38 
 
 		 111 aa  70.1  0.00000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2628  hypothetical protein  40.78 
 
 		 115 aa  67.4  0.00000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1964  hypothetical protein  44.62 
 
 		 106 aa  61.6  0.000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000240343  normal  0.0241485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3228  hypothetical protein  46.15 
 
 		 106 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.922801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2462  hypothetical protein  46.15 
 
 		 124 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0065  hypothetical protein  42.86 
 
 		 129 aa  60.1  0.00000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3484  hypothetical protein  41.67 
 
 		 106 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597105  normal  0.0535381 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39070  hypothetical protein  43.08 
 
 		 130 aa  58.5  0.00000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4579  hypothetical protein  40.95 
 
 		 101 aa  54.7  0.0000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2375  lipoprotein, putative  28.83 
 
 		 111 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1928  hypothetical protein  30.91 
 
 		 105 aa  50.1  0.000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00532973  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2159  putative lipoprotein  29.2 
 
 		 113 aa  49.3  0.00002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0219297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0078  lipoprotein, putative  36.92 
 
 		 104 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.473442 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1589  hypothetical protein  36.76 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.427706  decreased coverage  0.00475251 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1307  hypothetical protein  36.76 
 
 		 95 aa  47.8  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2942  hypothetical protein  30.21 
 
 		 103 aa  47.4  0.00006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3327  hypothetical protein  41.54 
 
 		 108 aa  45.4  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.23489  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0897  hypothetical protein  37.31 
 
 		 125 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3051  hypothetical protein  35.53 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1276  hypothetical protein  46.15 
 
 		 106 aa  44.3  0.0006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2191  hypothetical protein  33.33 
 
 		 90 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.016528  hitchhiker  0.00000426243 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0214  hypothetical protein  33.33 
 
 		 180 aa  42  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2264  hypothetical protein  29.85 
 
 		 119 aa  42  0.003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01900  hypothetical protein  38.55 
 
 		 87 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>