28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_2159 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_2159  putative lipoprotein  100 
 
 		 113 aa  227  3e-59  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0219297  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2375  lipoprotein, putative  86.73 
 
 		 111 aa  197  3e-50  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1928  hypothetical protein  47.79 
 
 		 105 aa  116  9.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00532973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1964  hypothetical protein  56.64 
 
 		 106 aa  106  1e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000240343  normal  0.0241485 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3228  hypothetical protein  67.16 
 
 		 106 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.922801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2462  hypothetical protein  67.16 
 
 		 124 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3484  hypothetical protein  55.79 
 
 		 106 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597105  normal  0.0535381 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0855  hypothetical protein  42.16 
 
 		 110 aa  77.8  0.00000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0920  hypothetical protein  42.16 
 
 		 110 aa  77.4  0.00000000000005  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0156018 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1343  hypothetical protein  43.24 
 
 		 107 aa  75.9  0.0000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2628  hypothetical protein  38.78 
 
 		 115 aa  66.6  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3576  hypothetical protein  37.89 
 
 		 111 aa  60.8  0.000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.395112  normal  0.317059 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4579  hypothetical protein  32.65 
 
 		 101 aa  60.1  0.00000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39070  hypothetical protein  40.3 
 
 		 130 aa  59.7  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3051  hypothetical protein  34.88 
 
 		 100 aa  54.3  0.0000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2942  hypothetical protein  28.3 
 
 		 103 aa  53.9  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4154  hypothetical protein  33.85 
 
 		 115 aa  52.4  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3327  hypothetical protein  40.3 
 
 		 108 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.23489  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03320  hypothetical protein  34.33 
 
 		 111 aa  51.2  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0857  hypothetical protein  32.5 
 
 		 101 aa  49.7  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.346144  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0065  hypothetical protein  33.78 
 
 		 129 aa  48.5  0.00003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2034  hypothetical protein  33.85 
 
 		 116 aa  47.8  0.00006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1276  hypothetical protein  39.39 
 
 		 106 aa  44.3  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0214  hypothetical protein  38.64 
 
 		 180 aa  44.3  0.0006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0897  hypothetical protein  33.85 
 
 		 125 aa  43.9  0.0007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01900  hypothetical protein  34.69 
 
 		 87 aa  43.1  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0078  lipoprotein, putative  34.55 
 
 		 104 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.473442 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0122  hypothetical protein  29.75 
 
 		 120 aa  42  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.177303  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>