27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Vapar_1276 on replicon NC_012791
Organism: Variovorax paradoxus S110



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012791  Vapar_1276  hypothetical protein  100 
 
 		 106 aa  205  2e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.357805  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0920  hypothetical protein  40.91 
 
 		 110 aa  77  0.00000000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.0156018 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0855  hypothetical protein  42.27 
 
 		 110 aa  74.7  0.0000000000004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03320  hypothetical protein  53.85 
 
 		 111 aa  72.4  0.000000000002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1343  hypothetical protein  46.51 
 
 		 107 aa  69.7  0.00000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2628  hypothetical protein  36.45 
 
 		 115 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1964  hypothetical protein  45.95 
 
 		 106 aa  62.8  0.000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000240343  normal  0.0241485 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3484  hypothetical protein  48.48 
 
 		 106 aa  63.5  0.000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597105  normal  0.0535381 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3228  hypothetical protein  48.48 
 
 		 106 aa  63.2  0.000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.922801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2462  hypothetical protein  48.48 
 
 		 124 aa  62.4  0.000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3576  hypothetical protein  44.58 
 
 		 111 aa  61.2  0.000000005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.395112  normal  0.317059 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2034  hypothetical protein  46.48 
 
 		 116 aa  59.7  0.00000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.825874 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4154  hypothetical protein  43.08 
 
 		 115 aa  60.1  0.00000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1928  hypothetical protein  43.94 
 
 		 105 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00532973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0065  hypothetical protein  44.74 
 
 		 129 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2375  lipoprotein, putative  36.54 
 
 		 111 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.368682  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2264  hypothetical protein  33.61 
 
 		 119 aa  55.8  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2159  putative lipoprotein  38.55 
 
 		 113 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0219297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0214  hypothetical protein  41.94 
 
 		 180 aa  55.1  0.0000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0897  hypothetical protein  41.54 
 
 		 125 aa  52.4  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4579  hypothetical protein  37.61 
 
 		 101 aa  50.4  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39070  hypothetical protein  40.91 
 
 		 130 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.291192 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3051  hypothetical protein  36 
 
 		 100 aa  47  0.00009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662958 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2942  hypothetical protein  33.33 
 
 		 103 aa  45.8  0.0002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2622  hypothetical protein  36.9 
 
 		 95 aa  43.9  0.0007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.244467  normal  0.660768 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3327  hypothetical protein  40.91 
 
 		 108 aa  42.7  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.23489  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01900  hypothetical protein  36.17 
 
 		 87 aa  40.4  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>