11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_2357 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_2357  hypothetical protein  100 
 
 		 98 aa  197  5e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.15841  normal  0.507342 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03320  hypothetical protein  36.36 
 
 		 111 aa  48.9  0.00002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3484  hypothetical protein  28.95 
 
 		 106 aa  44.7  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.597105  normal  0.0535381 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1928  hypothetical protein  26.97 
 
 		 105 aa  43.5  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00532973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0065  hypothetical protein  30.3 
 
 		 129 aa  42.4  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3228  hypothetical protein  28.79 
 
 		 106 aa  41.6  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.922801 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2462  hypothetical protein  28.79 
 
 		 124 aa  41.2  0.004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1964  hypothetical protein  27.03 
 
 		 106 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  decreased coverage  0.0000240343  normal  0.0241485 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0043  hypothetical protein  28 
 
 		 91 aa  41.2  0.005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.790029  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0214  hypothetical protein  34.34 
 
 		 180 aa  40.4  0.009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1230  hypothetical protein  31.88 
 
 		 118 aa  40  0.01  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.119331  normal  0.387929 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>