296 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_60105 on replicon NC_009045
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009045  PICST_60105  uridine nucleosidase (uridine ribohydrolase)  100 
 
 
348 aa  721    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.102312  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0201  ribosylpyrimidine nucleosidase  33.64 
 
 
309 aa  168  1e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.895466 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3626  Ribosylpyrimidine nucleosidase  32.51 
 
 
308 aa  162  7e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3734  Ribosylpyrimidine nucleosidase  32.13 
 
 
310 aa  160  2e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0028  Ribosylpyrimidine nucleosidase  37.04 
 
 
323 aa  159  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2587  ribosylpyrimidine nucleosidase  33.33 
 
 
313 aa  159  8e-38  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.361439  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1107  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.48 
 
 
315 aa  153  4e-36  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal  0.0266851 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4001  purine nucleosidase  35.79 
 
 
315 aa  153  5e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.454014  normal  0.413463 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1496  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.9 
 
 
313 aa  150  2e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0365306  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2459  ribonucleoside hydrolase 2  31.9 
 
 
313 aa  150  2e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0319  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  33.44 
 
 
312 aa  150  3e-35  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.182819 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3298  ribonucleoside hydrolase 2  32 
 
 
313 aa  150  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0466718  normal  0.0924764 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2914  nucleoside hydrolase  32.7 
 
 
313 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1558  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.7 
 
 
313 aa  150  4e-35  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.274753  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2309  ribonucleoside hydrolase 2  31.6 
 
 
313 aa  149  5e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.19142  hitchhiker  0.000812735 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1486  ribonucleoside hydrolase 2  31.6 
 
 
313 aa  149  6e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0358178  hitchhiker  0.000862517 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2298  ribonucleoside hydrolase 2  31.6 
 
 
313 aa  149  6e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02091  ribonucleoside hydrolase 2  31.6 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1158  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.54 
 
 
318 aa  149  1.0000000000000001e-34  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_04420  Inosine-uridine nucleoside N-ribohydrolase  31.6 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02050  hypothetical protein  31.6 
 
 
313 aa  148  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2117  Ribosylpyrimidine nucleosidase  32.62 
 
 
310 aa  148  2.0000000000000003e-34  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0564  Ribosylpyrimidine nucleosidase  31.25 
 
 
311 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.456269  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0877  ribonucleoside hydrolase 1  33.85 
 
 
314 aa  147  4.0000000000000006e-34  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.197182  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0006  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  38.58 
 
 
332 aa  146  5e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.194545  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0003  inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase  38.58 
 
 
332 aa  146  5e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00458868  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1652  purine nucleosidase  38.11 
 
 
316 aa  146  5e-34  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.197736 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4446  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.22 
 
 
311 aa  144  2e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0934  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.85 
 
 
313 aa  144  3e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0837501  normal  0.0202173 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0185  Purine nucleosidase  32.42 
 
 
355 aa  144  3e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0220  nonspecific ribonucleoside hydrolase  38.24 
 
 
350 aa  142  9e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1804  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.33 
 
 
311 aa  141  9.999999999999999e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.327684 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_28809  predicted protein  28.72 
 
 
388 aa  141  9.999999999999999e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  decreased coverage  0.00340732  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03052  hypothetical protein  33.9 
 
 
322 aa  141  1.9999999999999998e-32  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01760  nonspecific ribonucleoside hydrolase  37.87 
 
 
329 aa  140  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000285671  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0081  purine nucleosidase  32 
 
 
356 aa  140  1.9999999999999998e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0642  ribonucleoside hydrolase RihC  36.05 
 
 
302 aa  140  3e-32  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.0188198  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0718  ribonucleoside hydrolase 1  33.91 
 
 
311 aa  139  4.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.647996  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0672  ribonucleoside hydrolase 1  34.26 
 
 
311 aa  139  7.999999999999999e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.92 
 
 
314 aa  138  1e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000140534 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1210  ribonucleoside hydrolase 1  33.1 
 
 
310 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.178079  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0344  ribonucleoside hydrolase RihC  31.75 
 
 
315 aa  137  2e-31  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0009  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.94 
 
 
321 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.377078  normal  0.0385761 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00617  ribonucleoside hydrolase 1  33.91 
 
 
311 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2975  Purine nucleosidase  33.91 
 
 
311 aa  137  4e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00606  hypothetical protein  33.91 
 
 
311 aa  137  4e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0743  ribonucleoside hydrolase 1  33.91 
 
 
311 aa  137  4e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0598  ribonucleoside hydrolase 1  33.91 
 
 
311 aa  136  5e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2633  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  37.3 
 
 
338 aa  136  6.0000000000000005e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1049  ribonucleoside hydrolase 1  37.02 
 
 
312 aa  136  7.000000000000001e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3569  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.23 
 
 
304 aa  135  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2307  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.12 
 
 
330 aa  135  9e-31  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0234  purine nucleosidase  30.46 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0228  purine nucleosidase  30.46 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1178  ribonucleoside hydrolase 1  33.57 
 
 
313 aa  135  9.999999999999999e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0715691 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0696  ribonucleoside hydrolase 1  33.56 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0679  ribonucleoside hydrolase 1  33.9 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2994  ribonucleoside hydrolase 1  33.9 
 
 
311 aa  135  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0034  ribonucleoside hydrolase RihC  32.93 
 
 
304 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2618  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.82 
 
 
316 aa  134  1.9999999999999998e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4396  purine nucleosidase  31.38 
 
 
314 aa  135  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0030  ribonucleoside hydrolase RihC  32.93 
 
 
304 aa  134  3e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.719928  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0032  ribonucleoside hydrolase RihC  32.93 
 
 
304 aa  134  3e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3373  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.07 
 
 
317 aa  134  3e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00034  ribonucleoside hydrolase 3  33.33 
 
 
304 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00939814  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1120  ribonucleoside hydrolase 1  34.86 
 
 
312 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00033  hypothetical protein  33.33 
 
 
303 aa  133  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00634591  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0704  ribonucleoside hydrolase 1  33.45 
 
 
311 aa  133  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.56 
 
 
324 aa  133  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6548  Ribosylpyrimidine nucleosidase  32.95 
 
 
312 aa  133  5e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.527968  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0028  ribonucleoside hydrolase RihC  32.93 
 
 
304 aa  132  6e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.291651  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0032  ribonucleoside hydrolase RihC  33.33 
 
 
304 aa  133  6e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0814  ribonucleoside hydrolase 1  33.45 
 
 
311 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2373  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.26 
 
 
341 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138595  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0778  ribonucleoside hydrolase 1  33.45 
 
 
311 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0765  ribonucleoside hydrolase 1  33.1 
 
 
311 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1925  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.12 
 
 
342 aa  131  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0103421  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2157  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.26 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000654385  normal  0.648077 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3042  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.5 
 
 
341 aa  131  2.0000000000000002e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1442  Ribosylpyrimidine nucleosidase  33.33 
 
 
316 aa  130  3e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.792363  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2680  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.15 
 
 
322 aa  130  3e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00139292 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0050  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.69 
 
 
314 aa  130  3e-29  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000041602 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3579  ribonucleoside hydrolase 1  36.43 
 
 
318 aa  130  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3859  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.68 
 
 
322 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  unclonable  0.00000304796 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3408  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  31.86 
 
 
324 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3770  ribonucleoside hydrolase 1  35.47 
 
 
318 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3647  ribonucleoside hydrolase 1  36.06 
 
 
318 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0410931  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0660  ribonucleoside hydrolase 1  36.06 
 
 
318 aa  128  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0672  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  30.46 
 
 
306 aa  128  1.0000000000000001e-28  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2460  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  35.71 
 
 
322 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.237882  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2548  putative inosine-uridine preferring nucleoside hydrolase transmembrane protein  32.83 
 
 
351 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3486  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.26 
 
 
333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.389567  normal  0.0690731 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4253  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.11 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3230  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  36.09 
 
 
333 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.618451 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4026  ribonucleoside hydrolase 1  34.22 
 
 
310 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.494882  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1863  ribonucleoside hydrolase 1  33.68 
 
 
322 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.742774  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5010  inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  33.23 
 
 
350 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0017  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  32.82 
 
 
317 aa  126  4.0000000000000003e-28  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1356  Inosine/uridine-preferring nucleoside hydrolase  34.63 
 
 
311 aa  126  6e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3104  twin-arginine translocation pathway signal  32.93 
 
 
350 aa  126  7e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>