111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_37090 on replicon NC_009047
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009047  PICST_37090  predicted protein  100 
 
 
223 aa  452  1.0000000000000001e-126  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006694  CNI04220  GTPase inhibitor, putative  34.36 
 
 
225 aa  110  2.0000000000000002e-23  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.944407  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08847  phosducin-like protein (Eurofung)  28.34 
 
 
232 aa  97.4  2e-19  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_33850  predicted protein  31.58 
 
 
240 aa  89  5e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35416  predicted protein  32.73 
 
 
220 aa  88.6  8e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15411  normal  0.0272951 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13721  predicted protein  30.22 
 
 
136 aa  81.6  0.000000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30502  predicted protein  30.82 
 
 
197 aa  68.9  0.00000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00834692  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3665  thioredoxin  25.34 
 
 
150 aa  52.8  0.000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3596  thioredoxin  26.03 
 
 
150 aa  52  0.000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.854397  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3508  thioredoxin  29.79 
 
 
150 aa  51.6  0.000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4281  thioredoxin  30.14 
 
 
104 aa  50.4  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7798  thioredoxin  30.49 
 
 
146 aa  49.3  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.449565  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0652  thioredoxin  23.71 
 
 
150 aa  48.9  0.00007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_9043  thioredoxin  27.43 
 
 
108 aa  48.5  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.566731 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1214  thioredoxin  30.77 
 
 
121 aa  48.5  0.00009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal  0.0537365 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2429  thioredoxin  26.92 
 
 
107 aa  48.1  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  24.74 
 
 
104 aa  48.1  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_6068  thioredoxin  30.77 
 
 
110 aa  47.8  0.0001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.150927 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31565  predicted protein  27.78 
 
 
123 aa  48.1  0.0001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0686  thioredoxin  32.04 
 
 
290 aa  47  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2204  thioredoxin  24.75 
 
 
131 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.134551 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13949  thioredoxin trxC  28.21 
 
 
116 aa  47  0.0003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1342  thioredoxin  28.24 
 
 
130 aa  47  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3729  thioredoxin  22.79 
 
 
147 aa  46.6  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.350169  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0649  hypothetical protein  28.38 
 
 
109 aa  46.2  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.698912 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0351  thioredoxin  24.44 
 
 
107 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.537931  normal  0.872759 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5403  thioredoxin  29.49 
 
 
109 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5492  thioredoxin  29.49 
 
 
109 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0447616  normal  0.275979 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5779  thioredoxin  29.49 
 
 
109 aa  45.8  0.0005  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0581674  normal  0.154246 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3109  thioredoxin  31.11 
 
 
107 aa  45.8  0.0006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.168274  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3068  thioredoxin  27.71 
 
 
109 aa  45.4  0.0006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.61955e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0087  thioredoxin  28.21 
 
 
106 aa  45.8  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.950509 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0427  Thiol-disulfide isomerase or thioredoxin  26.32 
 
 
103 aa  45.4  0.0006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  1.66857e-16  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1038  thioredoxin  28.57 
 
 
277 aa  45.4  0.0006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0891  thioredoxin  28.57 
 
 
126 aa  45.4  0.0007  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0218  thioredoxin  24.66 
 
 
107 aa  45.1  0.0008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0838  thioredoxin  28.21 
 
 
109 aa  45.4  0.0008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.315208 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0816  thioredoxin  26.25 
 
 
107 aa  45.1  0.0008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0187  thioredoxin  27.18 
 
 
108 aa  44.3  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00849594 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1830  thioredoxin  27.14 
 
 
107 aa  44.3  0.001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.260875 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1608  thioredoxin  25.29 
 
 
131 aa  44.7  0.001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  decreased coverage  0.00442059  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0179  thioredoxin  28.21 
 
 
108 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0510  thioredoxin 1  28.21 
 
 
108 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0310601 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4035  thioredoxin  28.21 
 
 
108 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0966495  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0404  thioredoxin  31.33 
 
 
109 aa  45.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000190247  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0810  thioredoxin  25.56 
 
 
107 aa  45.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.195011 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2426  thioredoxin  25 
 
 
123 aa  44.7  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.660115  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0404  thioredoxin  32.53 
 
 
109 aa  44.3  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.986075 
 
 
-
 
NC_004310  BR2105  thioredoxin  26.25 
 
 
107 aa  43.9  0.002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0422234  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0788  thioredoxin  25.3 
 
 
110 aa  43.9  0.002  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2654  thioredoxin  23.21 
 
 
107 aa  43.9  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3230  thioredoxin  28.21 
 
 
109 aa  44.3  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000930614  normal  0.223494 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1976  thioredoxin  29.49 
 
 
109 aa  43.9  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1323  thioredoxin  27.14 
 
 
107 aa  43.9  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.131811  hitchhiker  0.00367785 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0987  thioredoxin  29.33 
 
 
124 aa  43.9  0.002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2021  thioredoxin  26.25 
 
 
107 aa  43.9  0.002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000945216  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3500  thioredoxin  26.67 
 
 
107 aa  43.9  0.002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4442  thioredoxin  27.71 
 
 
119 aa  43.5  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.553221 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0373  thioredoxin  31.43 
 
 
105 aa  43.9  0.002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1647  thioredoxin  28.24 
 
 
123 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.019473  hitchhiker  0.00109876 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1979  thioredoxin  28.24 
 
 
123 aa  43.9  0.002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.379887  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1367  hypothetical protein  29.41 
 
 
120 aa  43.1  0.003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1363  hypothetical protein  29.41 
 
 
120 aa  43.5  0.003  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4761  thioredoxin  26.6 
 
 
110 aa  43.5  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0308723  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1229  thioredoxin  31.43 
 
 
268 aa  43.5  0.003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.223518 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5310  thioredoxin  29.33 
 
 
124 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5399  thioredoxin  29.33 
 
 
124 aa  43.1  0.003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.35358 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1041  thioredoxin  33.33 
 
 
289 aa  43.5  0.003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.413095  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0215  thioredoxin  25.64 
 
 
105 aa  43.1  0.003  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.370161  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6113  thioredoxin  33.8 
 
 
406 aa  43.5  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0811  thioredoxin  25 
 
 
105 aa  43.5  0.003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4906  thioredoxin  27.71 
 
 
106 aa  43.5  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.803641  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0462  thioredoxin  30.12 
 
 
109 aa  43.1  0.004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000041281  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11340  putative thioredoxin  33.33 
 
 
289 aa  42.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000384652  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4504  thioredoxin  22.11 
 
 
108 aa  42.7  0.004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00999375 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1776  thioredoxin  26.44 
 
 
131 aa  42.7  0.004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.243739  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0510  thioredoxin  33.33 
 
 
290 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5023  thioredoxin  32.22 
 
 
290 aa  42.7  0.005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.929168  normal  0.995231 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3658  thioredoxin  27.27 
 
 
110 aa  42.4  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00522541  normal  0.779583 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0545  thioredoxin  33.33 
 
 
290 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0563  thioredoxin  33.33 
 
 
290 aa  42.4  0.005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.635588 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2254  thioredoxin  25.29 
 
 
132 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0831587  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2342  thioredoxin  25.29 
 
 
132 aa  42.4  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06670  Thioredoxin protein  32.22 
 
 
289 aa  42.7  0.005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.697288  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1867  thioredoxin  24.32 
 
 
106 aa  42.4  0.006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115873  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1793  thioredoxin  22.97 
 
 
107 aa  42.4  0.006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.99578  decreased coverage  0.00274383 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0295  thioredoxin  23.68 
 
 
104 aa  42.4  0.006  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4004  thioredoxin  26.92 
 
 
109 aa  42.4  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.897528  decreased coverage  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1456  thioredoxin  25 
 
 
108 aa  42.4  0.006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.724668  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0539  thioredoxin  22.67 
 
 
104 aa  42.4  0.006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.000000729683  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4115  thioredoxin  24.44 
 
 
107 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0402  thioredoxin  25.71 
 
 
107 aa  42.4  0.006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0895025 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0818  thioredoxin  24.44 
 
 
136 aa  42.4  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4155  thioredoxin  24.44 
 
 
107 aa  42.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.853934 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0102  thioredoxin  27.27 
 
 
140 aa  42.4  0.007  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0363  thioredoxin  29.73 
 
 
109 aa  42  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000145924  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0556  thioredoxin  33.33 
 
 
290 aa  42.4  0.007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.992322 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4231  thioredoxin  25.71 
 
 
107 aa  42  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000465688 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7087  thioredoxin  23.08 
 
 
108 aa  42  0.007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0826  thioredoxin  25 
 
 
102 aa  42  0.008  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  hitchhiker  0.000363889  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>