16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_33850 on replicon NC_009357
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009357  OSTLU_33850  predicted protein  100 
 
 
240 aa  491  9.999999999999999e-139  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_35416  predicted protein  36.13 
 
 
220 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.15411  normal  0.0272951 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13721  predicted protein  46.88 
 
 
136 aa  117  9.999999999999999e-26  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006694  CNI04220  GTPase inhibitor, putative  41.54 
 
 
225 aa  105  9e-22  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.944407  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08847  phosducin-like protein (Eurofung)  35.33 
 
 
232 aa  102  4e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011691  PHATRDRAFT_30502  predicted protein  34.62 
 
 
197 aa  99.8  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00834692  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_37090  predicted protein  31.94 
 
 
223 aa  88.2  1e-16  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29507  predicted protein  25.16 
 
 
307 aa  53.1  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.579767 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2664  thioredoxin  30.23 
 
 
104 aa  48.5  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0230  thioredoxin  21.31 
 
 
133 aa  47.4  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_56519  predicted protein  33.33 
 
 
700 aa  47  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.532885  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0776  thioredoxin  25 
 
 
138 aa  45.8  0.0006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.116689 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0921  thioredoxin  30.85 
 
 
107 aa  45.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0000000445063  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2350  thioredoxin  31.82 
 
 
104 aa  44.3  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2256  thioredoxin  35.23 
 
 
105 aa  44.3  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00435277 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0410  thioredoxin  29.55 
 
 
141 aa  43.9  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>