56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44733 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_44733  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  100 
 
 
210 aa  419  1e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27278  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  73.68 
 
 
209 aa  299  2e-80  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54065  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  63.59 
 
 
203 aa  266  2e-70  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38720  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  61.88 
 
 
212 aa  251  5.000000000000001e-66  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276094  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31645  fucoxanthin chlorophyll a/c binding protein-like protein  59.38 
 
 
252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0327158  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17531  fucoxanthin chlorophyll a/c protein  32.49 
 
 
193 aa  95.1  7e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29472  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  32.94 
 
 
246 aa  90.5  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.058235  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_56319  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  37.43 
 
 
260 aa  89.7  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000135148  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32294  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  34.62 
 
 
217 aa  86.7  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00953155  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43860  fucoxanthin chlorophyll a/c protein, lhcr type  33.33 
 
 
279 aa  86.7  3e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.195937  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50086  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  30 
 
 
232 aa  85.5  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.449896  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_56310  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  32.29 
 
 
206 aa  84.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38121  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  40.37 
 
 
206 aa  83.6  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43522  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  29.47 
 
 
270 aa  83.2  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44601  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  34.12 
 
 
200 aa  81.6  0.000000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25893  fucoxanthin chlorophyll a/c protein, lhcf type  32.46 
 
 
195 aa  80.9  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48882  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  33.33 
 
 
203 aa  77.8  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.208787  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22680  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  34.18 
 
 
197 aa  72.8  0.000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34536  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  29.77 
 
 
206 aa  72  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0741765  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_51230  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  33.92 
 
 
197 aa  72  0.000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.015864  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24045  Photosystem I light harvesting complex, chlorophyll a/b binding  35.03 
 
 
203 aa  71.2  0.00000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0272669  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25172  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  32.12 
 
 
198 aa  67.8  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.992243  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30031  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  33.14 
 
 
205 aa  65.5  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47813  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  32.39 
 
 
198 aa  64.3  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30648  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  30.91 
 
 
197 aa  62.8  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.765371  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30643  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  31.76 
 
 
204 aa  63.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.159415  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29266  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  31.76 
 
 
204 aa  63.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0970766  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17766  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  34.94 
 
 
215 aa  61.6  0.000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22395  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  32.3 
 
 
200 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.846762  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25168  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  34.16 
 
 
198 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0234139  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50705  protein fucoxanthin chlorophyl a/c protein  34.16 
 
 
198 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.348781  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54027  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  31.48 
 
 
202 aa  60.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23257  protein fucoxanthin chl a/c protein  33.73 
 
 
246 aa  60.1  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_6062  predicted protein  28.65 
 
 
199 aa  58.5  0.00000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0608102  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30780  prasinophyte light harvesting complex, chlorophyll binding  34.78 
 
 
233 aa  57.4  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71449  normal  0.246837 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27706  prasinophyte light harvesting complex, chlorophyll binding  34.78 
 
 
233 aa  57.4  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.59606 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22006  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  50.91 
 
 
199 aa  57.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29411  putative CP26, photosystem II light harvesting complex  31.98 
 
 
324 aa  57.8  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0569828  normal  0.0538058 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30781  prasinophyte light harvesting complex, chlorophyll binding  34.78 
 
 
233 aa  57.4  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.260173 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50137  prasinophyte light harvesting complex, chlorophyll binding  34.78 
 
 
233 aa  57.4  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0082373  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29120  prasinophyte light harvesting complex, chlorophyll binding protein  31.22 
 
 
254 aa  57.4  0.0000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48798  fucoxanthin chlorophyll a/c protein, deviant  30.62 
 
 
199 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18049  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  28.99 
 
 
196 aa  56.2  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50725  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  28.9 
 
 
199 aa  55.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.958322  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22956  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  30.51 
 
 
216 aa  55.8  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118133  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56448  fucoxanhin chlorophyll binding protein related  30.26 
 
 
205 aa  55.5  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_24119  fucoxanthin chlorophyll a/c protein, deviant  33.12 
 
 
239 aa  53.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000998161  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33699  chlorophyll a/b binding, possibly photosystem I light harvesting complex  31.18 
 
 
235 aa  53.5  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88576  chlorophyll a/b binding, possibly photosystem II light harvesting complex  31.68 
 
 
365 aa  52.8  0.000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0342385  normal  0.143202 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15820  predicted protein  30.5 
 
 
137 aa  52  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.829177  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31850  chlorophyll a/b binding, possibly photosystem I light harvesting complex  31.48 
 
 
185 aa  50.8  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.719224  normal  0.42101 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16302  protein fucoxanthin chlorophyll protein  27.08 
 
 
193 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34554  chlorophyll a/b binding, maybe photosystem I light harvesting complex  34.44 
 
 
252 aa  48.1  0.00009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47897  photosystem I light harvesting complex, chlorophyll a/b binding  28.12 
 
 
281 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.266881  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47485  fucoxanthin chlorophyll a/c protein, deviant  29.22 
 
 
235 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27891  possibly CP29, chlorophyll a/b binding  50 
 
 
260 aa  42  0.006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437755  normal  0.285879 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>