44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_51230 on replicon NC_011692
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011692  PHATRDRAFT_51230  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  100 
 
 
197 aa  399  9.999999999999999e-111  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.015864  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30648  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  93.91 
 
 
197 aa  339  1e-92  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.765371  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18049  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  85.2 
 
 
196 aa  314  5e-85  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22395  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  76.26 
 
 
200 aa  311  5.999999999999999e-84  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.846762  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25168  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  79.8 
 
 
198 aa  302  3.0000000000000004e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0234139  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50705  protein fucoxanthin chlorophyl a/c protein  79.8 
 
 
198 aa  302  3.0000000000000004e-81  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.348781  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25172  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  82.14 
 
 
198 aa  295  2e-79  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.992243  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30031  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  67.51 
 
 
205 aa  260  8e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22006  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  70.2 
 
 
199 aa  257  9e-68  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30643  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  67.43 
 
 
204 aa  245  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.159415  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29266  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  67.43 
 
 
204 aa  245  2e-64  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0970766  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16302  protein fucoxanthin chlorophyll protein  57.23 
 
 
193 aa  179  2e-44  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22680  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  43.09 
 
 
197 aa  128  6e-29  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25893  fucoxanthin chlorophyll a/c protein, lhcf type  44.15 
 
 
195 aa  115  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27278  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  39.3 
 
 
209 aa  108  6e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48882  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  37.5 
 
 
203 aa  108  7.000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.208787  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_56310  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  39.2 
 
 
206 aa  104  9e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34536  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  34.48 
 
 
206 aa  84.3  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0741765  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17531  fucoxanthin chlorophyll a/c protein  30.81 
 
 
193 aa  74.7  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54065  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  32 
 
 
203 aa  72.8  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44733  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  33.92 
 
 
210 aa  71.2  0.000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38720  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  29.59 
 
 
212 aa  68.6  0.00000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276094  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47813  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  32.99 
 
 
198 aa  62.8  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50725  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  39.42 
 
 
199 aa  61.2  0.000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.958322  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38121  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  36.68 
 
 
206 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23257  protein fucoxanthin chl a/c protein  26.75 
 
 
246 aa  60.1  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56448  fucoxanhin chlorophyll binding protein related  31.29 
 
 
205 aa  59.3  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31645  fucoxanthin chlorophyll a/c binding protein-like protein  32.18 
 
 
252 aa  58.9  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0327158  normal 
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_24119  fucoxanthin chlorophyll a/c protein, deviant  29.61 
 
 
239 aa  53.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000998161  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32294  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  29.72 
 
 
217 aa  52.8  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00953155  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29472  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  26.29 
 
 
246 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.058235  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48798  fucoxanthin chlorophyll a/c protein, deviant  27.04 
 
 
199 aa  50.4  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50086  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  29.57 
 
 
232 aa  48.5  0.00007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.449896  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47485  fucoxanthin chlorophyll a/c protein, deviant  24.64 
 
 
235 aa  47.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_6062  predicted protein  32.62 
 
 
199 aa  46.2  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0608102  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43522  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  26.11 
 
 
270 aa  45.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54027  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  55.81 
 
 
202 aa  45.8  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27891  possibly CP29, chlorophyll a/b binding  52.63 
 
 
260 aa  44.3  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437755  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29120  prasinophyte light harvesting complex, chlorophyll binding protein  42.19 
 
 
254 aa  43.9  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27706  prasinophyte light harvesting complex, chlorophyll binding  41.18 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.59606 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50137  prasinophyte light harvesting complex, chlorophyll binding  41.18 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0082373  normal 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30781  prasinophyte light harvesting complex, chlorophyll binding  41.18 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.260173 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30780  prasinophyte light harvesting complex, chlorophyll binding  41.18 
 
 
233 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71449  normal  0.246837 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17766  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  30.8 
 
 
215 aa  41.2  0.009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>