50 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_38121 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_38121  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  100 
 
 		 206 aa  422  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47813  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  55.92 
 
 		 198 aa  163  2.0000000000000002e-39  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17766  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  42.37 
 
 		 215 aa  110  1.0000000000000001e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44601  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  38.99 
 
 		 200 aa  103  2e-21  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54027  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  37.71 
 
 		 202 aa  99.8  2e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23257  protein fucoxanthin chl a/c protein  37.29 
 
 		 246 aa  99  4e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29472  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  35.32 
 
 		 246 aa  92.8  3e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.058235  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_56319  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  38.78 
 
 		 260 aa  91.7  8e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000135148  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50086  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  33.94 
 
 		 232 aa  90.5  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.449896  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27278  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  36.49 
 
 		 209 aa  89.7  2e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43522  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  36.25 
 
 		 270 aa  86.7  2e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22956  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  40.65 
 
 		 216 aa  85.5  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118133  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32294  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  37.24 
 
 		 217 aa  83.6  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00953155  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44733  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  40.62 
 
 		 210 aa  84  0.000000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22680  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  36.6 
 
 		 197 aa  80.5  0.00000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43860  fucoxanthin chlorophyll a/c protein, lhcr type  34.02 
 
 		 279 aa  79.3  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.195937  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38720  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  36.02 
 
 		 212 aa  78.2  0.00000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276094  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22395  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  36.32 
 
 		 200 aa  77  0.0000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.846762  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25893  fucoxanthin chlorophyll a/c protein, lhcf type  40 
 
 		 195 aa  75.1  0.0000000000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54065  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  34.81 
 
 		 203 aa  74.7  0.000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50725  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  33.11 
 
 		 199 aa  70.1  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.958322  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48882  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  37.04 
 
 		 203 aa  70.5  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.208787  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_56310  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  33.99 
 
 		 206 aa  67.8  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31645  fucoxanthin chlorophyll a/c binding protein-like protein  34.53 
 
 		 252 aa  67.4  0.0000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0327158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33699  chlorophyll a/b binding, possibly photosystem I light harvesting complex  33.33 
 
 		 235 aa  64.7  0.0000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17531  fucoxanthin chlorophyll a/c protein  32.99 
 
 		 193 aa  64.7  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_6062  predicted protein  35 
 
 		 199 aa  64.7  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0608102  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48798  fucoxanthin chlorophyll a/c protein, deviant  30.54 
 
 		 199 aa  63.9  0.000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34554  chlorophyll a/b binding, maybe photosystem I light harvesting complex  34.81 
 
 		 252 aa  60.8  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25172  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  35.46 
 
 		 198 aa  61.2  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.992243  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31850  chlorophyll a/b binding, possibly photosystem I light harvesting complex  31.45 
 
 		 185 aa  59.7  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.719224  normal  0.42101 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50705  protein fucoxanthin chlorophyl a/c protein  35.92 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.348781  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25168  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  35.92 
 
 		 198 aa  59.3  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0234139  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_24119  fucoxanthin chlorophyll a/c protein, deviant  31.11 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000998161  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34536  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  33.55 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0741765  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22006  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  34.67 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30031  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  34.25 
 
 		 205 aa  56.2  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56448  fucoxanhin chlorophyll binding protein related  27.96 
 
 		 205 aa  55.5  0.0000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24045  Photosystem I light harvesting complex, chlorophyll a/b binding  30.59 
 
 		 203 aa  55.5  0.0000006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0272669  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30648  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  33.33 
 
 		 197 aa  53.9  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.765371  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_51230  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  34.25 
 
 		 197 aa  53.5  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.015864  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88576  chlorophyll a/b binding, possibly photosystem II light harvesting complex  28.73 
 
 		 365 aa  51.6  0.000008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0342385  normal  0.143202 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18049  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  34.46 
 
 		 196 aa  50.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16302  protein fucoxanthin chlorophyll protein  32.61 
 
 		 193 aa  51.2  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15820  predicted protein  30.66 
 
 		 137 aa  50.1  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.829177  n/a   
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47897  photosystem I light harvesting complex, chlorophyll a/b binding  31.55 
 
 		 281 aa  49.3  0.00004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.266881  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29411  putative CP26, photosystem II light harvesting complex  28.07 
 
 		 324 aa  48.9  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0569828  normal  0.0538058 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47485  fucoxanthin chlorophyll a/c protein, deviant  28.83 
 
 		 235 aa  45.4  0.0005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30643  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  31.21 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.159415  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29266  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  31.21 
 
 		 204 aa  44.7  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0970766  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>