36 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48798 on replicon NC_011687
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011687  PHATRDRAFT_48798  fucoxanthin chlorophyll a/c protein, deviant  100 
 
 		 199 aa  406  1e-113  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_24119  fucoxanthin chlorophyll a/c protein, deviant  34.23 
 
 		 239 aa  70.9  0.00000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000998161  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54027  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  31.88 
 
 		 202 aa  67.4  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17531  fucoxanthin chlorophyll a/c protein  31.66 
 
 		 193 aa  65.1  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34536  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  29.02 
 
 		 206 aa  64.3  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0741765  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38121  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  32.9 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17766  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  32.65 
 
 		 215 aa  60.5  0.00000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38720  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  29.31 
 
 		 212 aa  57  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276094  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44733  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  31.45 
 
 		 210 aa  55.1  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22395  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  28.93 
 
 		 200 aa  54.3  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.846762  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44601  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  28 
 
 		 200 aa  53.1  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_47485  fucoxanthin chlorophyll a/c protein, deviant  31.19 
 
 		 235 aa  52.8  0.000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22680  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  30.39 
 
 		 197 aa  52  0.000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25893  fucoxanthin chlorophyll a/c protein, lhcf type  31.98 
 
 		 195 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50086  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  27.63 
 
 		 232 aa  49.7  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.449896  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27278  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  28.37 
 
 		 209 aa  49.3  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32294  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  30.14 
 
 		 217 aa  49.3  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00953155  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_56319  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  26.7 
 
 		 260 aa  48.5  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000135148  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54065  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  29.47 
 
 		 203 aa  48.1  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22956  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  29.93 
 
 		 216 aa  47.8  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118133  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22006  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  28.12 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48882  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  25 
 
 		 203 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.208787  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43522  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  30.82 
 
 		 270 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34554  chlorophyll a/b binding, maybe photosystem I light harvesting complex  32.64 
 
 		 252 aa  47  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25168  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  27.33 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0234139  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50705  protein fucoxanthin chlorophyl a/c protein  27.33 
 
 		 198 aa  45.8  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.348781  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_51230  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  26.79 
 
 		 197 aa  45.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.015864  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56448  fucoxanhin chlorophyll binding protein related  26.34 
 
 		 205 aa  44.3  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29266  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  27.27 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0970766  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30643  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  27.27 
 
 		 204 aa  43.9  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.159415  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_6062  predicted protein  29.6 
 
 		 199 aa  43.9  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0608102  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33699  chlorophyll a/b binding, possibly photosystem I light harvesting complex  26.22 
 
 		 235 aa  43.5  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30648  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  26.19 
 
 		 197 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.765371  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16302  protein fucoxanthin chlorophyll protein  28.3 
 
 		 193 aa  42.4  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31850  chlorophyll a/b binding, possibly photosystem I light harvesting complex  32.1 
 
 		 185 aa  42.4  0.005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.719224  normal  0.42101 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30031  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  28.47 
 
 		 205 aa  41.6  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>