39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_56448 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_56448  fucoxanhin chlorophyll binding protein related  100 
 
 		 205 aa  422  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_56310  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  31.64 
 
 		 206 aa  75.5  0.0000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22395  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  30.29 
 
 		 200 aa  63.2  0.000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.846762  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22680  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  27.57 
 
 		 197 aa  62.8  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47813  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  34.53 
 
 		 198 aa  62.4  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_30031  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  33.13 
 
 		 205 aa  60.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54027  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  31.69 
 
 		 202 aa  60.8  0.00000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_51230  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  31.29 
 
 		 197 aa  59.3  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.015864  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17531  fucoxanthin chlorophyll a/c protein  31.88 
 
 		 193 aa  59.3  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30643  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  31.94 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.159415  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25168  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  30.12 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0234139  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50705  protein fucoxanthin chlorophyl a/c protein  30.12 
 
 		 198 aa  56.6  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.348781  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_29266  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  31.94 
 
 		 204 aa  56.2  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0970766  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44733  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  30.26 
 
 		 210 aa  55.5  0.0000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25893  fucoxanthin chlorophyll a/c protein, lhcf type  32.81 
 
 		 195 aa  55.1  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27278  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  29.56 
 
 		 209 aa  55.1  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38121  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  30.82 
 
 		 206 aa  55.1  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25172  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  30.34 
 
 		 198 aa  53.9  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.992243  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_16302  protein fucoxanthin chlorophyll protein  30 
 
 		 193 aa  53.1  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18049  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  29.03 
 
 		 196 aa  52.4  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30648  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  28.83 
 
 		 197 aa  52  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.765371  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48882  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  30.43 
 
 		 203 aa  51.6  0.000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.208787  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88576  chlorophyll a/b binding, possibly photosystem II light harvesting complex  31.93 
 
 		 365 aa  51.2  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0342385  normal  0.143202 
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_22006  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  29.78 
 
 		 199 aa  50.8  0.00001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22956  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  24.68 
 
 		 216 aa  48.5  0.00006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118133  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38720  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  26.88 
 
 		 212 aa  48.1  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276094  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32294  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  34.97 
 
 		 217 aa  47.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00953155  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17766  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  29.71 
 
 		 215 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43522  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  28.29 
 
 		 270 aa  47.4  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44601  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  28.86 
 
 		 200 aa  46.2  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54065  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  27.39 
 
 		 203 aa  46.6  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_56319  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  30.2 
 
 		 260 aa  45.4  0.0006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000135148  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34536  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  30.87 
 
 		 206 aa  45.1  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0741765  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48798  fucoxanthin chlorophyll a/c protein, deviant  26.34 
 
 		 199 aa  44.3  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31645  fucoxanthin chlorophyll a/c binding protein-like protein  28.06 
 
 		 252 aa  43.9  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0327158  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29472  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  28.29 
 
 		 246 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.058235  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50725  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  29.29 
 
 		 199 aa  42.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.958322  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23257  protein fucoxanthin chl a/c protein  30.77 
 
 		 246 aa  41.2  0.01  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33699  chlorophyll a/b binding, possibly photosystem I light harvesting complex  29.03 
 
 		 235 aa  41.2  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>