34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_88576 on replicon NC_009365
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009365  OSTLU_88576  chlorophyll a/b binding, possibly photosystem II light harvesting complex  100 
 
 		 365 aa  733    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0342385  normal  0.143202 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33699  chlorophyll a/b binding, possibly photosystem I light harvesting complex  41 
 
 		 235 aa  110  3e-23  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29411  putative CP26, photosystem II light harvesting complex  35.1 
 
 		 324 aa  105  2e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0569828  normal  0.0538058 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31850  chlorophyll a/b binding, possibly photosystem I light harvesting complex  37.63 
 
 		 185 aa  95.1  2e-18  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.719224  normal  0.42101 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24045  Photosystem I light harvesting complex, chlorophyll a/b binding  36.5 
 
 		 203 aa  90.5  4e-17  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0272669  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34554  chlorophyll a/b binding, maybe photosystem I light harvesting complex  34.57 
 
 		 252 aa  86.3  8e-16  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22956  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  33.16 
 
 		 216 aa  84.3  0.000000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118133  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27891  possibly CP29, chlorophyll a/b binding  32.74 
 
 		 260 aa  79  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437755  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47897  photosystem I light harvesting complex, chlorophyll a/b binding  34.15 
 
 		 281 aa  77  0.0000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.266881  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_56319  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  33.99 
 
 		 260 aa  71.6  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000135148  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29472  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  31.37 
 
 		 246 aa  67  0.0000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.058235  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_6062  predicted protein  29.19 
 
 		 199 aa  65.9  0.000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0608102  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43860  fucoxanthin chlorophyll a/c protein, lhcr type  30.35 
 
 		 279 aa  63.9  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.195937  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29120  prasinophyte light harvesting complex, chlorophyll binding protein  34.94 
 
 		 254 aa  61.6  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43522  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  28.02 
 
 		 270 aa  61.2  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50137  prasinophyte light harvesting complex, chlorophyll binding  34.32 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0082373  normal  1 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30780  prasinophyte light harvesting complex, chlorophyll binding  34.32 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71449  normal  0.246837 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30781  prasinophyte light harvesting complex, chlorophyll binding  34.32 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.260173 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32294  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  32.37 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00953155  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27706  prasinophyte light harvesting complex, chlorophyll binding  34.32 
 
 		 233 aa  60.5  0.00000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.59606 
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44601  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  29.94 
 
 		 200 aa  59.7  0.00000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50725  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  32.04 
 
 		 199 aa  57.8  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.958322  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27278  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  32.99 
 
 		 209 aa  54.7  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17766  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  33.16 
 
 		 215 aa  53.1  0.000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44733  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  31.19 
 
 		 210 aa  52  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38121  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  28.73 
 
 		 206 aa  50.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38720  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  28.57 
 
 		 212 aa  50.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276094  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50086  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  28.74 
 
 		 232 aa  50.4  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.449896  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56448  fucoxanhin chlorophyll binding protein related  31.93 
 
 		 205 aa  50.8  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54027  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  28.49 
 
 		 202 aa  47.8  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54065  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  25.35 
 
 		 203 aa  46.2  0.0009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47813  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  27.47 
 
 		 198 aa  44.7  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22680  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  28.75 
 
 		 197 aa  43.1  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31645  fucoxanthin chlorophyll a/c binding protein-like protein  30.99 
 
 		 252 aa  42.7  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0327158  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>