23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_27706 on replicon NC_009369
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009357  OSTLU_30780  prasinophyte light harvesting complex, chlorophyll binding  100 
 
 
233 aa  476  1e-133  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.71449  normal  0.246837 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_30781  prasinophyte light harvesting complex, chlorophyll binding  100 
 
 
233 aa  476  1e-133  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.260173 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_50137  prasinophyte light harvesting complex, chlorophyll binding  100 
 
 
233 aa  476  1e-133  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.0082373  normal 
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27706  prasinophyte light harvesting complex, chlorophyll binding  100 
 
 
233 aa  476  1e-133  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.59606 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29120  prasinophyte light harvesting complex, chlorophyll binding protein  83.41 
 
 
254 aa  380  1e-104  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24045  Photosystem I light harvesting complex, chlorophyll a/b binding  37.89 
 
 
203 aa  81.6  0.000000000000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0272669  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29411  putative CP26, photosystem II light harvesting complex  33.33 
 
 
324 aa  78.2  0.0000000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0569828  normal  0.0538058 
 
 
-
 
NC_009371  OSTLU_47897  photosystem I light harvesting complex, chlorophyll a/b binding  32.8 
 
 
281 aa  75.9  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.266881  normal  0.436801 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31850  chlorophyll a/b binding, possibly photosystem I light harvesting complex  29.41 
 
 
185 aa  63.5  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.719224  normal  0.42101 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33699  chlorophyll a/b binding, possibly photosystem I light harvesting complex  31.58 
 
 
235 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88576  chlorophyll a/b binding, possibly photosystem II light harvesting complex  34.32 
 
 
365 aa  60.5  0.00000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0342385  normal  0.143202 
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27278  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  31.22 
 
 
209 aa  60.1  0.00000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44733  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  34.78 
 
 
210 aa  57  0.0000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_009369  OSTLU_27891  possibly CP29, chlorophyll a/b binding  34.15 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.437755  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54065  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  32.12 
 
 
203 aa  55.5  0.0000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34554  chlorophyll a/b binding, maybe photosystem I light harvesting complex  27.33 
 
 
252 aa  52  0.000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31645  fucoxanthin chlorophyll a/c binding protein-like protein  30.38 
 
 
252 aa  50.4  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0327158  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_6062  predicted protein  31.08 
 
 
199 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0608102  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22680  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  36.51 
 
 
197 aa  42.4  0.006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44601  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  36.62 
 
 
200 aa  42.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_51230  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  51.16 
 
 
197 aa  42.4  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.015864  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25168  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  42.86 
 
 
198 aa  42  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0234139  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50705  protein fucoxanthin chlorophyl a/c protein  42.86 
 
 
198 aa  42  0.008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.348781  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>