41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_29472 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_29472  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  100 
 
 		 246 aa  507  1e-143  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.058235  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_43860  fucoxanthin chlorophyll a/c protein, lhcr type  53.36 
 
 		 279 aa  273  2.0000000000000002e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.195937  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_56319  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  65.08 
 
 		 260 aa  262  4e-69  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000000135148  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43522  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  46.51 
 
 		 270 aa  227  1e-58  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011694  PHATRDRAFT_50086  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  45.45 
 
 		 232 aa  201  9.999999999999999e-51  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.449896  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_32294  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  45.83 
 
 		 217 aa  155  5.0000000000000005e-37  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00953155  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_27278  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  32 
 
 		 209 aa  95.9  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_22956  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  32.61 
 
 		 216 aa  91.3  1e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.118133  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44733  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  32.94 
 
 		 210 aa  90.1  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.133072  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44601  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  34.78 
 
 		 200 aa  86.3  5e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54065  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  29.73 
 
 		 203 aa  84.7  0.000000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_38121  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  36.94 
 
 		 206 aa  80.1  0.00000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17766  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  33.52 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_6062  predicted protein  32.68 
 
 		 199 aa  73.6  0.000000000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0608102  n/a   
 
 
-
 
NC_011690  PHATRDRAFT_23257  protein fucoxanthin chl a/c protein  30.45 
 
 		 246 aa  70.9  0.00000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_38720  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  27.47 
 
 		 212 aa  68.2  0.0000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.276094  n/a   
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31645  fucoxanthin chlorophyll a/c binding protein-like protein  30.36 
 
 		 252 aa  68.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0327158  normal  1 
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_88576  chlorophyll a/b binding, possibly photosystem II light harvesting complex  31.22 
 
 		 365 aa  67  0.0000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0342385  normal  0.143202 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50725  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  29.63 
 
 		 199 aa  65.9  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.958322  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_54027  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  29.38 
 
 		 202 aa  63.2  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_29411  putative CP26, photosystem II light harvesting complex  33.7 
 
 		 324 aa  61.2  0.00000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0569828  normal  0.0538058 
 
 
-
 
NC_009359  OSTLU_31850  chlorophyll a/b binding, possibly photosystem I light harvesting complex  32.14 
 
 		 185 aa  60.5  0.00000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.719224  normal  0.42101 
 
 
-
 
NC_009357  OSTLU_34554  chlorophyll a/b binding, maybe photosystem I light harvesting complex  29.83 
 
 		 252 aa  59.7  0.00000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  0.100817 
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_56310  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  33.14 
 
 		 206 aa  59.3  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_47813  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  29.27 
 
 		 198 aa  58.2  0.0000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17531  fucoxanthin chlorophyll a/c protein  32.03 
 
 		 193 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_15820  predicted protein  30.77 
 
 		 137 aa  56.6  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.829177  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_22680  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  28.57 
 
 		 197 aa  53.9  0.000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24045  Photosystem I light harvesting complex, chlorophyll a/b binding  27.62 
 
 		 203 aa  51.6  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0272669  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_22395  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  25.76 
 
 		 200 aa  50.1  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.846762  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30648  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  29.53 
 
 		 197 aa  49.3  0.00005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.765371  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_50705  protein fucoxanthin chlorophyl a/c protein  25.64 
 
 		 198 aa  48.9  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.348781  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_25168  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  25.64 
 
 		 198 aa  48.9  0.00008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0234139  n/a   
 
 
-
 
NC_011687  PHATRDRAFT_48882  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  29.08 
 
 		 203 aa  48.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.208787  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_33699  chlorophyll a/b binding, possibly photosystem I light harvesting complex  27.92 
 
 		 235 aa  46.2  0.0004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34536  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  28 
 
 		 206 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0741765  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_18049  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  27.92 
 
 		 196 aa  45.1  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_25893  fucoxanthin chlorophyll a/c protein, lhcf type  28.06 
 
 		 195 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_51230  protein fucoxanthin chlorophyll a/c protein  27.67 
 
 		 197 aa  43.1  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.015864  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_56448  fucoxanhin chlorophyll binding protein related  28.29 
 
 		 205 aa  43.1  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011698  PHATRDRAFT_24119  fucoxanthin chlorophyll a/c protein, deviant  28.96 
 
 		 239 aa  42.7  0.005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  hitchhiker  0.000998161  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>