More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_44719 on replicon NC_011673
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011673  PHATRDRAFT_44719  predicted protein  100 
 
 
365 aa  755    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6138  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  40.82 
 
 
340 aa  132  7.999999999999999e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.809218 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15491  short-chain dehydrogenase/reductase  30.63 
 
 
309 aa  130  4.0000000000000003e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.821697  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15641  short-chain dehydrogenase/reductase  30.31 
 
 
309 aa  127  3e-28  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15241  short-chain dehydrogenase/reductase  29.87 
 
 
309 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.957013  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1341  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  34.62 
 
 
307 aa  123  5e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0989891  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1459  short-chain dehydrogenase/reductase  29.69 
 
 
309 aa  123  6e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.392397  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2970  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.45 
 
 
305 aa  119  9.999999999999999e-26  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.234131  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14681  dehydrogenase  30.43 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.0164309 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0763  short chain dehydrogenase  30.32 
 
 
316 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.920637  normal  0.460734 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0744  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  32.17 
 
 
319 aa  114  3e-24  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.24495 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_15671  short-chain dehydrogenase/reductase  31.33 
 
 
300 aa  109  6e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0732777  normal  0.472072 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0729  short-chain dehydrogenase/reductase  30 
 
 
308 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.486158  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2915  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.02 
 
 
326 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3350  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.05 
 
 
314 aa  106  7e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.244541  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1813  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.94 
 
 
301 aa  105  2e-21  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000491998  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2984  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 
324 aa  104  3e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.627737  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1065  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.79 
 
 
312 aa  103  6e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.334573  normal  0.72801 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2219  short-chain dehydrogenase/reductase  29.17 
 
 
301 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.498421  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2106  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.5 
 
 
298 aa  100  4e-20  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0407655  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0151  short chain dehydrogenase  27.68 
 
 
305 aa  98.2  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0167  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.68 
 
 
313 aa  96.7  6e-19  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0839  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.21 
 
 
304 aa  96.3  7e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.177477  normal  0.189843 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3223  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.53 
 
 
298 aa  96.3  7e-19  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.928112  hitchhiker  0.00000218148 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3193  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.04 
 
 
305 aa  95.5  1e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.132217  hitchhiker  0.00451656 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2789  short chain dehydrogenase  28.61 
 
 
304 aa  95.1  2e-18  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.625532  normal  0.190884 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5463  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.57 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.109998 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2613  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.74 
 
 
298 aa  93.6  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.68402  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0032  short chain dehydrogenase  28.65 
 
 
300 aa  93.2  6e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.249754  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17961  Short-chain dehydrogenase/reductase (SDR) superfamily protein  27.19 
 
 
300 aa  93.2  6e-18  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.140714 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0851  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.18 
 
 
304 aa  92.4  1e-17  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0651953  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2564  short-chain dehydrogenase/reductase  28.27 
 
 
302 aa  92.4  1e-17  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.554832  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1016  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.73 
 
 
324 aa  92.4  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.010862 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0762  short chain dehydrogenase  29.03 
 
 
302 aa  91.7  2e-17  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.812053  normal  0.782214 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1943  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.29 
 
 
320 aa  91.3  2e-17  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.756699  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4249  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.82 
 
 
312 aa  91.3  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.3435  normal  0.21236 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1313  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.38 
 
 
320 aa  90.5  4e-17  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.435553 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0902  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.11 
 
 
303 aa  89.4  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0811669 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4327  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.76 
 
 
312 aa  88.6  2e-16  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5862  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.9 
 
 
297 aa  88.2  2e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1546  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.62 
 
 
305 aa  87.4  3e-16  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0325177 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0069  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.59 
 
 
310 aa  87.4  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0206248  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_02813  oxidoreductase, short-chain dehydrogenase/reductase family (AFU_orthologue; AFUA_2G04560)  32.07 
 
 
268 aa  87  5e-16  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.0000285176  normal  0.115904 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2783  Short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.62 
 
 
327 aa  86.7  5e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12290  short chain dehydrogenase  26.45 
 
 
317 aa  87  5e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.521938  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0143  short chain dehydrogenase  27.67 
 
 
303 aa  86.3  7e-16  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4973  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.02 
 
 
328 aa  86.3  8e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0852  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.15 
 
 
307 aa  85.9  9e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0401995  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0520  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27 
 
 
317 aa  85.5  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0596  short chain dehydrogenase  26.67 
 
 
306 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0609  short chain dehydrogenase  26.67 
 
 
306 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1940  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.33 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.944669 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2977  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.74 
 
 
316 aa  84.3  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0587  short chain dehydrogenase  25.5 
 
 
306 aa  84.3  0.000000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3909  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  31.34 
 
 
306 aa  82.8  0.000000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.235938  normal  0.0957503 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0196  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.3 
 
 
317 aa  82.4  0.00000000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1061  short chain dehydrogenase  29.35 
 
 
320 aa  82.4  0.00000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4631  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.43 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.79705  normal  0.423189 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4252  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.43 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4338  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  27.43 
 
 
289 aa  81.6  0.00000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.582042  normal  0.314505 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3573  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.07 
 
 
298 aa  81.3  0.00000000000002  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00455  probable oxidoreductase  26.01 
 
 
318 aa  81.6  0.00000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3312  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.82 
 
 
290 aa  80.9  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.113909 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7668  putative short chain dehydrogenase  26.35 
 
 
318 aa  81.3  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.685626  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RS05496  putative oxidoreductase protein  30.63 
 
 
306 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.58284 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_08603  conserved hypothetical protein  28.01 
 
 
417 aa  79.3  0.00000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0856  dehydrogenase  27.35 
 
 
333 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.944789  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4459  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.55 
 
 
303 aa  79.3  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3572  short chain dehydrogenase  26.53 
 
 
308 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_10567  predicted protein  29.74 
 
 
284 aa  79.3  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1842  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.63 
 
 
328 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0766  dehydrogenase  27.35 
 
 
329 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6815  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.43 
 
 
312 aa  79  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4786  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.47 
 
 
288 aa  79  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1013  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.57 
 
 
324 aa  79.3  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3626  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  30.49 
 
 
306 aa  78.2  0.0000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.474498  normal 
 
 
-
 
NC_009375  OSTLU_89854  predicted protein  26.55 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.264825  hitchhiker  0.0060203 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_88990  predicted protein  26.55 
 
 
363 aa  78.2  0.0000000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0137755 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2134  short chain dehydrogenase/reductase family oxidoreductase  26.63 
 
 
329 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331088  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0887  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.52 
 
 
324 aa  77.4  0.0000000000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_5468  predicted protein  33.61 
 
 
292 aa  77  0.0000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0753  short chain dehydrogenase  25.66 
 
 
305 aa  76.3  0.0000000000008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0399  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.43 
 
 
315 aa  76.3  0.0000000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.118358 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10068  short chain dehydrogenase  26.61 
 
 
303 aa  76.3  0.0000000000009  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.362569 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0860  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  25.15 
 
 
287 aa  75.5  0.000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.943731  normal  0.246629 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4434  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  26.32 
 
 
316 aa  75.9  0.000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.79228  n/a   
 
 
-
 
BN001302  ANIA_10514  short-chain dehydrogenase/reductase family protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G02770)  28.72 
 
 
349 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03305  short chain dehydrogenase/reductase family protein (AFU_orthologue; AFUA_5G14310)  29.08 
 
 
331 aa  74.7  0.000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5239  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.45 
 
 
328 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10444  short chain dehydrogenase  25.81 
 
 
311 aa  74.3  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.270892  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3322  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.45 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5045  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.45 
 
 
328 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.373197 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0605  short chain dehydrogenase  27.74 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.140006  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1514  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.19 
 
 
343 aa  73.9  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.550402 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0618  short chain dehydrogenase  27.74 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.673408  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0596  short chain dehydrogenase  27.74 
 
 
300 aa  73.9  0.000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3918  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  29.27 
 
 
306 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.272807  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6760  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  28.96 
 
 
309 aa  73.6  0.000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4174  short chain dehydrogenase  26.16 
 
 
312 aa  73.6  0.000000000006  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.865375  normal 
 
 
-
 
NC_011692  PHATRDRAFT_30578  predicted protein  27.73 
 
 
352 aa  73.2  0.000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>