More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_18398 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_18398  predicted protein  100 
 
 
305 aa  629  1e-179  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1048  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.33 
 
 
296 aa  179  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0112  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.41 
 
 
287 aa  179  5.999999999999999e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.643325  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3407  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.07 
 
 
287 aa  177  2e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.347136  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1225  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.43 
 
 
299 aa  177  2e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2087  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.31 
 
 
291 aa  177  2e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.562661  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3951  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.77 
 
 
287 aa  175  7e-43  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4036  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.77 
 
 
287 aa  175  9e-43  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00118016 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3817  F0F1 ATP synthase subunit gamma  38.1 
 
 
290 aa  174  9.999999999999999e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.196477  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0973  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.41 
 
 
289 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2298  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.41 
 
 
289 aa  172  5.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2202  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.73 
 
 
289 aa  170  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_29009  F-ATPase family transporter: protons (mitochondrial)  37.72 
 
 
328 aa  169  5e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.859793  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4262  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.68 
 
 
287 aa  167  2e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.201982  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3653  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.57 
 
 
294 aa  166  4e-40  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.641548  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1464  ATP synthase F1, gamma subunit  35.91 
 
 
294 aa  166  5e-40  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0322274  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2935  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.01 
 
 
290 aa  166  5.9999999999999996e-40  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0612014  normal  0.0524462 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3171  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.37 
 
 
288 aa  165  6.9999999999999995e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0210307  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3942  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.23 
 
 
294 aa  165  1.0000000000000001e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3217  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.52 
 
 
290 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0622  F0F1 ATP synthase subunit gamma  37.04 
 
 
294 aa  163  4.0000000000000004e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.899409 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3459  ATP synthase F1, gamma subunit  36.61 
 
 
292 aa  160  2e-38  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6636  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.33 
 
 
292 aa  159  4e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.191354 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1314  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.79 
 
 
293 aa  160  4e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.891662  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03065  H+-transporting two-sector ATPase, gamma subunit  35.27 
 
 
289 aa  159  7e-38  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0605  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.58 
 
 
288 aa  159  7e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0910315  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00252  ATP synthase gamma chain, mitochondrial precursor, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03510)  36.68 
 
 
296 aa  158  1e-37  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.508779  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2401  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.71 
 
 
290 aa  158  1e-37  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1466  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.33 
 
 
295 aa  157  2e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.152433 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1680  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.84 
 
 
296 aa  157  2e-37  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.997729  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1506  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.69 
 
 
288 aa  157  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1745  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.33 
 
 
296 aa  157  3e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0472622  normal  0.162191 
 
 
-
 
NC_006687  CNE00750  ATP synthase gamma chain, mitochondrial precursor, putative  37.38 
 
 
288 aa  156  4e-37  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.30729  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4738  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.79 
 
 
294 aa  155  5.0000000000000005e-37  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.439609  decreased coverage  0.00190337 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7381  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.9 
 
 
292 aa  155  6e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1060  ATP synthase F1, gamma subunit  36.21 
 
 
286 aa  155  7e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2923  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.69 
 
 
291 aa  155  8e-37  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.112114  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1467  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.67 
 
 
296 aa  154  1e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0719668 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3365  F0F1 ATP synthase subunit gamma  36.15 
 
 
290 aa  155  1e-36  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0342  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.9 
 
 
291 aa  154  1e-36  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00305412 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0604  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.67 
 
 
296 aa  152  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.141777  normal  0.984338 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0113  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.75 
 
 
302 aa  152  8e-36  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2079  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.9 
 
 
291 aa  151  2e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.434618 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4107  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.12 
 
 
293 aa  149  5e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.171115  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0219  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.33 
 
 
293 aa  149  7e-35  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.195785 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4496  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.9 
 
 
290 aa  148  1.0000000000000001e-34  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.869664  normal  0.0447387 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21410  ATP synthase, F1 gamma subunit  33.44 
 
 
303 aa  147  3e-34  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.740846  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3347  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.13 
 
 
291 aa  146  4.0000000000000006e-34  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.752399  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1800  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.11 
 
 
292 aa  145  8.000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0907814  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2379  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.99 
 
 
282 aa  145  8.000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.013052 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1733  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.11 
 
 
292 aa  145  8.000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.341678  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7249  ATP synthase F1, gamma subunit  34.47 
 
 
294 aa  145  1e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.000178532  normal  0.626732 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3339  ATP synthase F1 subuint gamma  31.11 
 
 
315 aa  144  1e-33  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6524  ATP synthase F1, gamma subunit  33.67 
 
 
297 aa  142  5e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0419  F0F1 ATP synthase subunit gamma  35.37 
 
 
290 aa  142  5e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2213  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.96 
 
 
289 aa  143  5e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.357273  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.54 
 
 
292 aa  142  6e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0400801  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4631  ATP synthase F1, gamma subunit  34.81 
 
 
294 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.553634  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3495  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.88 
 
 
291 aa  141  1.9999999999999998e-32  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.055909  normal  0.57378 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0948  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.96 
 
 
288 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3132  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.96 
 
 
288 aa  140  3e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.88 
 
 
292 aa  140  3.9999999999999997e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4792  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.45 
 
 
281 aa  139  3.9999999999999997e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2803  ATP synthase F1, gamma subunit  32.57 
 
 
295 aa  139  3.9999999999999997e-32  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3204  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.19 
 
 
288 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.558351  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2911  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.03 
 
 
288 aa  139  4.999999999999999e-32  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4071  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.55 
 
 
295 aa  139  4.999999999999999e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0711089  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4046  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.51 
 
 
286 aa  139  4.999999999999999e-32  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.359211  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2808  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.19 
 
 
288 aa  139  4.999999999999999e-32  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.432553  normal  0.299257 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5483  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.99 
 
 
286 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.99 
 
 
286 aa  139  6e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5156  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.99 
 
 
286 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4988  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.99 
 
 
286 aa  139  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5006  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.99 
 
 
286 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp3054  F0F1 ATP synthase subunit gamma  30.03 
 
 
288 aa  139  6e-32  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5427  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.99 
 
 
286 aa  139  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.218624  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5548  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.99 
 
 
286 aa  139  6e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0289901  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5397  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.99 
 
 
286 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.19374e-43 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2583  ATP synthase F1, gamma subunit  32.08 
 
 
292 aa  139  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0500866  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2431  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.56 
 
 
289 aa  139  7e-32  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0717942  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3416  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.88 
 
 
285 aa  139  7e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5523  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.99 
 
 
286 aa  139  7.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00196906  hitchhiker  0.0000000000000668462 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0397  ATP synthase F1, gamma subunit  33.33 
 
 
293 aa  138  8.999999999999999e-32  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.524985 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0514  ATP synthase F1, gamma subunit  35 
 
 
294 aa  138  1e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_91482  ATP synthase gamma subunit  33.45 
 
 
261 aa  138  1e-31  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.905393 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0196  Sodium-transporting two-sector ATPase  31.97 
 
 
291 aa  137  2e-31  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4349  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.45 
 
 
289 aa  137  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2326  ATP synthase F1, gamma subunit  31.03 
 
 
286 aa  137  2e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0244217  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1526  F0F1 ATP synthase subunit gamma  34.45 
 
 
295 aa  137  2e-31  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  decreased coverage  0.000000258594  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4485  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.88 
 
 
290 aa  137  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3826  F0F1 ATP synthase subunit gamma  33.22 
 
 
286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0337  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.03 
 
 
316 aa  137  3.0000000000000003e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.292551  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1710  ATP synthase F1, gamma subunit  34.91 
 
 
270 aa  137  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.088665  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5104  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.29 
 
 
286 aa  136  3.0000000000000003e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2187  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.86 
 
 
294 aa  136  3.0000000000000003e-31  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0513  F0F1 ATP synthase subunit gamma  29.86 
 
 
290 aa  136  4e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04084  F0F1 ATP synthase subunit gamma  31.72 
 
 
286 aa  136  5e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00162731  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0307  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.41 
 
 
288 aa  135  6.0000000000000005e-31  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.185722  normal  0.044669 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4504  F0F1 ATP synthase subunit gamma  32.99 
 
 
290 aa  135  6.0000000000000005e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_20657  precursor of ATPase ATPase gamma subunit  30.99 
 
 
369 aa  135  6.0000000000000005e-31  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.363655  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>