46 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_2393 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2393  hypothetical protein  100 
 
 
241 aa  502  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2445  hypothetical protein  87.39 
 
 
240 aa  446  1.0000000000000001e-124  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1833  hypothetical protein  33.5 
 
 
476 aa  115  7.999999999999999e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424586  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1097  hypothetical protein  32.84 
 
 
215 aa  103  3e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  35.14 
 
 
442 aa  92  8e-18  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2286  hypothetical protein  27.01 
 
 
222 aa  84.7  0.000000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3722  hypothetical protein  29.81 
 
 
214 aa  79  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6098  hypothetical protein  29.29 
 
 
213 aa  78.6  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.014139  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3723  hypothetical protein  29.44 
 
 
211 aa  74.3  0.000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2182  hypothetical protein  27.18 
 
 
221 aa  71.2  0.00000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.942905  normal  0.83113 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  28.29 
 
 
524 aa  70.9  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1029  hypothetical protein  25 
 
 
225 aa  70.9  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617928  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04341  hypothetical protein  25.67 
 
 
234 aa  68.9  0.00000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2047  hypothetical protein  28.04 
 
 
213 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3425  hypothetical protein  28 
 
 
236 aa  65.9  0.0000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2241  hypothetical protein  25 
 
 
223 aa  63.9  0.000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7151  hypothetical protein  28.04 
 
 
231 aa  63.2  0.000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0335  hypothetical protein  26.63 
 
 
287 aa  62.8  0.000000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.871928  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3626  hypothetical protein  28.28 
 
 
277 aa  61.2  0.00000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0366  hypothetical protein  25.76 
 
 
272 aa  60.5  0.00000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00723  hypothetical protein  26.54 
 
 
285 aa  60.1  0.00000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0881472  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0557  hypothetical protein  25.37 
 
 
240 aa  60.1  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48406  predicted protein  25.68 
 
 
369 aa  59.3  0.00000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.701766  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1657  hypothetical protein  25.42 
 
 
211 aa  59.3  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12342  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2127  hypothetical protein  25.39 
 
 
208 aa  58.9  0.00000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0840601  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3805  hypothetical protein  26.26 
 
 
272 aa  58.2  0.0000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2687  hypothetical protein  22.96 
 
 
208 aa  55.8  0.0000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0274676 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3608  hypothetical protein  25.79 
 
 
221 aa  55.5  0.0000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0365  hypothetical protein  25.13 
 
 
272 aa  55.1  0.0000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4507  hypothetical protein  27.27 
 
 
255 aa  55.1  0.000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3844  hypothetical protein  25.27 
 
 
260 aa  55.1  0.000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0954  hypothetical protein  22.6 
 
 
219 aa  55.1  0.000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0151297  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0358  hypothetical protein  25.42 
 
 
305 aa  54.3  0.000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4978  hypothetical protein  23.41 
 
 
215 aa  52.8  0.000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0360  hypothetical protein  24.47 
 
 
305 aa  53.1  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5888  hypothetical protein  25.23 
 
 
241 aa  52.8  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0368  hypothetical protein  24.86 
 
 
323 aa  51.6  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000028153 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3991  hypothetical protein  24.18 
 
 
199 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375654  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09311  conserved hypothetical protein  25.91 
 
 
258 aa  50.1  0.00003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.125843  normal  0.822415 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4926  hypothetical protein  24.24 
 
 
251 aa  49.7  0.00004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000829023 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3861  hypothetical protein  30.21 
 
 
229 aa  48.5  0.00009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.248681  unclonable  0.00000280431 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3924  hypothetical protein  23.04 
 
 
233 aa  48.1  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349522  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0273  hypothetical protein  24.75 
 
 
231 aa  47  0.0003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0044  hypothetical protein  26.63 
 
 
227 aa  47  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09208  conserved hypothetical protein  27.01 
 
 
295 aa  45.4  0.0007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1501  hypothetical protein  25.28 
 
 
216 aa  42.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0508793  hitchhiker  0.000844236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>