33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Snas_2687 on replicon NC_013947
Organism: Stackebrandtia nassauensis DSM 44728



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013947  Snas_2687  hypothetical protein  100 
 
 
208 aa  424  1e-118  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0274676 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2127  hypothetical protein  70.39 
 
 
208 aa  303  1.0000000000000001e-81  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0840601  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1029  hypothetical protein  38.14 
 
 
225 aa  166  2e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617928  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6098  hypothetical protein  41 
 
 
213 aa  166  2e-40  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.014139  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2182  hypothetical protein  40.58 
 
 
221 aa  166  2.9999999999999998e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.942905  normal  0.83113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4978  hypothetical protein  40 
 
 
215 aa  157  9e-38  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2286  hypothetical protein  41.06 
 
 
222 aa  149  2e-35  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0954  hypothetical protein  40.19 
 
 
219 aa  146  2.0000000000000003e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0151297  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04341  hypothetical protein  37.37 
 
 
234 aa  132  3e-30  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5888  hypothetical protein  34.09 
 
 
241 aa  131  6e-30  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3723  hypothetical protein  35.5 
 
 
211 aa  129  2.0000000000000002e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3722  hypothetical protein  35.64 
 
 
214 aa  127  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00723  hypothetical protein  33.33 
 
 
285 aa  125  5e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0881472  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7151  hypothetical protein  36.22 
 
 
231 aa  122  4e-27  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3924  hypothetical protein  35.43 
 
 
233 aa  120  9.999999999999999e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349522  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0557  hypothetical protein  33.18 
 
 
240 aa  105  7e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09208  conserved hypothetical protein  28.38 
 
 
295 aa  81.3  0.000000000000009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09311  conserved hypothetical protein  31.17 
 
 
258 aa  80.9  0.00000000000001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.125843  normal  0.822415 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48406  predicted protein  27.76 
 
 
369 aa  80.9  0.00000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.701766  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43516  predicted protein  28.09 
 
 
360 aa  65.5  0.0000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.019532  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2445  hypothetical protein  23.16 
 
 
240 aa  60.8  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2393  hypothetical protein  22.96 
 
 
241 aa  55.8  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1833  hypothetical protein  27.32 
 
 
476 aa  51.2  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424586  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1097  hypothetical protein  23.35 
 
 
215 aa  50.1  0.00002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  25.12 
 
 
524 aa  50.1  0.00002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  24.5 
 
 
442 aa  48.1  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33199  predicted protein  25 
 
 
257 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4926  hypothetical protein  30 
 
 
251 aa  45.4  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000829023 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3626  hypothetical protein  25.41 
 
 
277 aa  43.5  0.002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0366  hypothetical protein  24.02 
 
 
272 aa  43.1  0.003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0358  hypothetical protein  27.36 
 
 
305 aa  42.7  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3805  hypothetical protein  26.25 
 
 
272 aa  42.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0335  hypothetical protein  23.6 
 
 
287 aa  41.6  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.871928  normal  0.553114 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>