21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_43516 on replicon NC_011670
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011670  PHATRDRAFT_43516  predicted protein  100 
 
 
360 aa  734    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.019532  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48406  predicted protein  29.27 
 
 
369 aa  94.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.701766  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5888  hypothetical protein  29.63 
 
 
241 aa  82.4  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1029  hypothetical protein  30.33 
 
 
225 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617928  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0557  hypothetical protein  29.34 
 
 
240 aa  75.5  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2286  hypothetical protein  29.88 
 
 
222 aa  74.7  0.000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.387299 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09311  conserved hypothetical protein  29.8 
 
 
258 aa  74.3  0.000000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.125843  normal  0.822415 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2182  hypothetical protein  28.16 
 
 
221 aa  73.2  0.000000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.942905  normal  0.83113 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6098  hypothetical protein  27.64 
 
 
213 aa  69.7  0.00000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.014139  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2687  hypothetical protein  28.09 
 
 
208 aa  65.5  0.000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0274676 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00723  hypothetical protein  29.71 
 
 
285 aa  63.5  0.000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0881472  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2127  hypothetical protein  29.36 
 
 
208 aa  62.8  0.000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0840601  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04341  hypothetical protein  28.64 
 
 
234 aa  62.8  0.000000009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3723  hypothetical protein  26.07 
 
 
211 aa  62  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3924  hypothetical protein  25.91 
 
 
233 aa  61.2  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349522  normal 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09208  conserved hypothetical protein  26.3 
 
 
295 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3722  hypothetical protein  26.16 
 
 
214 aa  59.3  0.00000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4978  hypothetical protein  26.67 
 
 
215 aa  57.4  0.0000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7151  hypothetical protein  29.6 
 
 
231 aa  54.7  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33199  predicted protein  25.58 
 
 
257 aa  51.6  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0954  hypothetical protein  24.9 
 
 
219 aa  43.5  0.006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0151297  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>