29 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Strop_2182 on replicon NC_009380
Organism: Salinispora tropica CNB-440



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009380  Strop_2182  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  461  1e-129  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.942905  normal  0.83113 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4978  hypothetical protein  46.51 
 
 		 215 aa  198  6e-50  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6098  hypothetical protein  41.12 
 
 		 213 aa  182  4.0000000000000006e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.014139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1029  hypothetical protein  41.2 
 
 		 225 aa  177  1e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617928  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2687  hypothetical protein  39.82 
 
 		 208 aa  166  2.9999999999999998e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0274676 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2127  hypothetical protein  38.89 
 
 		 208 aa  154  1e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0840601  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04341  hypothetical protein  35.94 
 
 		 234 aa  146  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2286  hypothetical protein  37.5 
 
 		 222 aa  144  8.000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3723  hypothetical protein  38.12 
 
 		 211 aa  142  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3722  hypothetical protein  39.8 
 
 		 214 aa  137  8.999999999999999e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0954  hypothetical protein  33.65 
 
 		 219 aa  135  6.0000000000000005e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0151297  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00723  hypothetical protein  36.23 
 
 		 285 aa  127  2.0000000000000002e-28  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0881472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5888  hypothetical protein  31.6 
 
 		 241 aa  125  4.0000000000000003e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7151  hypothetical protein  35.05 
 
 		 231 aa  125  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3924  hypothetical protein  33.19 
 
 		 233 aa  120  1.9999999999999998e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349522  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0557  hypothetical protein  32.73 
 
 		 240 aa  112  4.0000000000000004e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48406  predicted protein  31.44 
 
 		 369 aa  100  1e-20  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.701766  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09311  conserved hypothetical protein  30.77 
 
 		 258 aa  90.1  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.125843  normal  0.822415 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09208  conserved hypothetical protein  32.26 
 
 		 295 aa  89.7  3e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43516  predicted protein  27.78 
 
 		 360 aa  73.9  0.000000000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.019532  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2393  hypothetical protein  27.72 
 
 		 241 aa  70.5  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  28.02 
 
 		 524 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2445  hypothetical protein  28.22 
 
 		 240 aa  67.4  0.0000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1833  hypothetical protein  28.12 
 
 		 476 aa  64.3  0.000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  26.7 
 
 		 442 aa  59.3  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1097  hypothetical protein  24.75 
 
 		 215 aa  55.1  0.0000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0366  hypothetical protein  24.76 
 
 		 272 aa  46.2  0.0004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3805  hypothetical protein  25.24 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33199  predicted protein  22.52 
 
 		 257 aa  42.7  0.004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>