37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1097 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_1097  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  449  1e-125  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1833  hypothetical protein  34.36 
 
 		 476 aa  103  2e-21  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2393  hypothetical protein  32.84 
 
 		 241 aa  103  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2445  hypothetical protein  31.66 
 
 		 240 aa  100  2e-20  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0044  hypothetical protein  33.15 
 
 		 227 aa  93.2  3e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1029  hypothetical protein  26.25 
 
 		 225 aa  75.5  0.0000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617928  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  30.43 
 
 		 442 aa  75.5  0.0000000000006  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  27.36 
 
 		 524 aa  75.1  0.0000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4978  hypothetical protein  26.82 
 
 		 215 aa  59.3  0.00000005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7151  hypothetical protein  26.77 
 
 		 231 aa  56.2  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2182  hypothetical protein  24.75 
 
 		 221 aa  55.1  0.0000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.942905  normal  0.83113 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3723  hypothetical protein  25.12 
 
 		 211 aa  55.1  0.0000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0954  hypothetical protein  24.52 
 
 		 219 aa  52  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0151297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43602  predicted protein  29.6 
 
 		 302 aa  50.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0174997  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2687  hypothetical protein  23.35 
 
 		 208 aa  50.1  0.00003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0274676 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2286  hypothetical protein  20.83 
 
 		 222 aa  49.7  0.00003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3991  hypothetical protein  24.47 
 
 		 199 aa  49.7  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375654  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00723  hypothetical protein  23.35 
 
 		 285 aa  48.9  0.00006  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0881472  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3924  hypothetical protein  25.24 
 
 		 233 aa  48.5  0.00008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349522  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3844  hypothetical protein  21.88 
 
 		 260 aa  47  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04341  hypothetical protein  22.55 
 
 		 234 aa  47  0.0002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1657  hypothetical protein  25.13 
 
 		 211 aa  46.6  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12342  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3722  hypothetical protein  25.36 
 
 		 214 aa  45.8  0.0005  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6098  hypothetical protein  24.43 
 
 		 213 aa  45.1  0.0007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.014139  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0557  hypothetical protein  22.94 
 
 		 240 aa  45.1  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0365  hypothetical protein  22.46 
 
 		 272 aa  44.7  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_31658  predicted protein  30.63 
 
 		 300 aa  43.5  0.002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.629391  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0358  hypothetical protein  21.39 
 
 		 305 aa  43.5  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0273  hypothetical protein  24.04 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3425  hypothetical protein  25.27 
 
 		 236 aa  43.5  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2047  hypothetical protein  23.36 
 
 		 213 aa  43.9  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0368  hypothetical protein  21.39 
 
 		 323 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000028153 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4507  hypothetical protein  23.81 
 
 		 255 aa  43.1  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0360  hypothetical protein  20.86 
 
 		 305 aa  43.1  0.003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5888  hypothetical protein  24.19 
 
 		 241 aa  42.7  0.004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3861  hypothetical protein  21.08 
 
 		 229 aa  42  0.007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.248681  unclonable  0.00000280431 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1501  hypothetical protein  27.44 
 
 		 216 aa  42  0.008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0508793  hitchhiker  0.000844236 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>