28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew_3861 on replicon NC_009092
Organism: Shewanella loihica PV-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009092  Shew_3861  hypothetical protein  100 
 
 		 229 aa  476  1e-133  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.248681  unclonable  0.00000280431 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4926  hypothetical protein  60.43 
 
 		 251 aa  302  2.0000000000000002e-81  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000829023 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4507  hypothetical protein  64.76 
 
 		 255 aa  294  8e-79  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3844  hypothetical protein  59.24 
 
 		 260 aa  284  7e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3608  hypothetical protein  62.67 
 
 		 221 aa  276  2e-73  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3626  hypothetical protein  63.26 
 
 		 277 aa  275  3e-73  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0335  hypothetical protein  61.82 
 
 		 287 aa  273  2.0000000000000002e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.871928  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3805  hypothetical protein  60 
 
 		 272 aa  271  6e-72  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0366  hypothetical protein  60 
 
 		 272 aa  266  2e-70  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0360  hypothetical protein  52.53 
 
 		 305 aa  258  6e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0358  hypothetical protein  52.53 
 
 		 305 aa  256  2e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3425  hypothetical protein  56 
 
 		 236 aa  255  4e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0368  hypothetical protein  51.36 
 
 		 323 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000028153 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0365  hypothetical protein  50.38 
 
 		 272 aa  251  8.000000000000001e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2241  hypothetical protein  54.67 
 
 		 223 aa  239  2e-62  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2047  hypothetical protein  53.92 
 
 		 213 aa  224  8e-58  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0273  hypothetical protein  48.48 
 
 		 231 aa  198  6e-50  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1657  hypothetical protein  35.44 
 
 		 211 aa  141  9e-33  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1501  hypothetical protein  36.32 
 
 		 216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0508793  hitchhiker  0.000844236 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33199  predicted protein  26.18 
 
 		 257 aa  55.1  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2445  hypothetical protein  24.1 
 
 		 240 aa  51.2  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  27.06 
 
 		 524 aa  49.7  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3991  hypothetical protein  23.56 
 
 		 199 aa  49.7  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  24.26 
 
 		 442 aa  49.3  0.00005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2393  hypothetical protein  30.21 
 
 		 241 aa  48.5  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0557  hypothetical protein  25.86 
 
 		 240 aa  45.4  0.0007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1833  hypothetical protein  26.13 
 
 		 476 aa  43.5  0.003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1097  hypothetical protein  21.08 
 
 		 215 aa  42  0.008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>