28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_4926 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_4926  hypothetical protein  100 
 
 		 251 aa  527  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000829023 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4507  hypothetical protein  69 
 
 		 255 aa  334  1e-90  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3608  hypothetical protein  63 
 
 		 221 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3844  hypothetical protein  58.56 
 
 		 260 aa  309  2.9999999999999997e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0335  hypothetical protein  57.94 
 
 		 287 aa  307  1.0000000000000001e-82  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.871928  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3805  hypothetical protein  63.11 
 
 		 272 aa  305  4.0000000000000004e-82  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3861  hypothetical protein  60.43 
 
 		 229 aa  302  3.0000000000000004e-81  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.248681  unclonable  0.00000280431 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3626  hypothetical protein  58.47 
 
 		 277 aa  301  4.0000000000000003e-81  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0366  hypothetical protein  60.44 
 
 		 272 aa  295  6e-79  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0360  hypothetical protein  52.92 
 
 		 305 aa  276  3e-73  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0368  hypothetical protein  52.14 
 
 		 323 aa  275  6e-73  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000028153 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0358  hypothetical protein  50 
 
 		 305 aa  274  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0365  hypothetical protein  52.14 
 
 		 272 aa  273  1.0000000000000001e-72  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3425  hypothetical protein  54 
 
 		 236 aa  271  7e-72  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2241  hypothetical protein  53.19 
 
 		 223 aa  261  6e-69  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2047  hypothetical protein  54.39 
 
 		 213 aa  254  9e-67  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0273  hypothetical protein  43.93 
 
 		 231 aa  202  5e-51  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1657  hypothetical protein  38.54 
 
 		 211 aa  152  5.9999999999999996e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12342  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1501  hypothetical protein  34.91 
 
 		 216 aa  136  4e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0508793  hitchhiker  0.000844236 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  27.19 
 
 		 524 aa  61.6  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2393  hypothetical protein  24.24 
 
 		 241 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2445  hypothetical protein  24.61 
 
 		 240 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  25.87 
 
 		 442 aa  47.4  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3991  hypothetical protein  26.25 
 
 		 199 aa  47  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375654  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2687  hypothetical protein  30 
 
 		 208 aa  45.4  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0274676 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1833  hypothetical protein  23.47 
 
 		 476 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33199  predicted protein  27.59 
 
 		 257 aa  45.4  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2286  hypothetical protein  22.27 
 
 		 222 aa  44.7  0.001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.387299 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>