26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_1657 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_1657  hypothetical protein  100 
 
 		 211 aa  444  1.0000000000000001e-124  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12342  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2047  hypothetical protein  42.86 
 
 		 213 aa  173  1.9999999999999998e-42  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2241  hypothetical protein  39.61 
 
 		 223 aa  167  1e-40  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3626  hypothetical protein  38.81 
 
 		 277 aa  167  1e-40  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0335  hypothetical protein  38.31 
 
 		 287 aa  166  2e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.871928  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0366  hypothetical protein  38.31 
 
 		 272 aa  166  2.9999999999999998e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3805  hypothetical protein  38.31 
 
 		 272 aa  165  5e-40  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3425  hypothetical protein  41.15 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3844  hypothetical protein  37.67 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4507  hypothetical protein  39.71 
 
 		 255 aa  162  3e-39  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3608  hypothetical protein  37.62 
 
 		 221 aa  161  6e-39  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0273  hypothetical protein  37.96 
 
 		 231 aa  152  2.9999999999999998e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4926  hypothetical protein  38.54 
 
 		 251 aa  152  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000829023 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1501  hypothetical protein  39.2 
 
 		 216 aa  151  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0508793  hitchhiker  0.000844236 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0358  hypothetical protein  34.43 
 
 		 305 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0360  hypothetical protein  33.2 
 
 		 305 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0365  hypothetical protein  32.79 
 
 		 272 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0368  hypothetical protein  33.61 
 
 		 323 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000028153 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3861  hypothetical protein  35.44 
 
 		 229 aa  141  7e-33  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.248681  unclonable  0.00000280431 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2445  hypothetical protein  27.68 
 
 		 240 aa  63.2  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2393  hypothetical protein  25.42 
 
 		 241 aa  59.3  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1833  hypothetical protein  26.29 
 
 		 476 aa  57.4  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  26.04 
 
 		 524 aa  54.3  0.000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  28.04 
 
 		 442 aa  49.3  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1097  hypothetical protein  25.13 
 
 		 215 aa  46.6  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3991  hypothetical protein  25.65 
 
 		 199 aa  47  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375654  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>