41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmar10_1833 on replicon NC_008347
Organism: Maricaulis maris MCS10



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008347  Mmar10_1833  hypothetical protein  100 
 
 
476 aa  987    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424586  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2445  hypothetical protein  35.6 
 
 
240 aa  119  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2393  hypothetical protein  33.5 
 
 
241 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1097  hypothetical protein  34.36 
 
 
215 aa  103  8e-21  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  30.3 
 
 
442 aa  87.4  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2182  hypothetical protein  28.71 
 
 
221 aa  62.4  0.00000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.942905  normal  0.83113 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00723  hypothetical protein  28.3 
 
 
285 aa  60.8  0.00000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0881472  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4507  hypothetical protein  27.7 
 
 
255 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000275437 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1029  hypothetical protein  28.02 
 
 
225 aa  58.9  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617928  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1657  hypothetical protein  26.29 
 
 
211 aa  57.4  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.12342  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3991  hypothetical protein  31.16 
 
 
199 aa  56.6  0.000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.375654  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0273  hypothetical protein  28.5 
 
 
231 aa  54.7  0.000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  24.02 
 
 
524 aa  54.7  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0476944 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3844  hypothetical protein  25.39 
 
 
260 aa  54.7  0.000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04341  hypothetical protein  25.39 
 
 
234 aa  54.7  0.000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2241  hypothetical protein  25 
 
 
223 aa  54.3  0.000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0335  hypothetical protein  25.28 
 
 
287 aa  54.3  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.871928  normal  0.553114 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2127  hypothetical protein  26.83 
 
 
208 aa  53.5  0.000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0840601  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0368  hypothetical protein  23.22 
 
 
323 aa  52.8  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000028153 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0365  hypothetical protein  22.75 
 
 
272 aa  53.1  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1501  hypothetical protein  27.37 
 
 
216 aa  52  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0508793  hitchhiker  0.000844236 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0358  hypothetical protein  22.78 
 
 
305 aa  52.4  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0360  hypothetical protein  22.75 
 
 
305 aa  51.6  0.00003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2687  hypothetical protein  27.32 
 
 
208 aa  51.2  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0274676 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2047  hypothetical protein  24.28 
 
 
213 aa  49.7  0.0001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5888  hypothetical protein  26.92 
 
 
241 aa  49.7  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0366  hypothetical protein  21.83 
 
 
272 aa  48.5  0.0002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6098  hypothetical protein  33.98 
 
 
213 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.014139  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3805  hypothetical protein  22.28 
 
 
272 aa  48.5  0.0003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3425  hypothetical protein  21.94 
 
 
236 aa  47.8  0.0004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3626  hypothetical protein  22.91 
 
 
277 aa  47  0.0007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7151  hypothetical protein  29.38 
 
 
231 aa  47  0.0007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0557  hypothetical protein  32.32 
 
 
240 aa  46.2  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3608  hypothetical protein  22.73 
 
 
221 aa  45.4  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2286  hypothetical protein  26.96 
 
 
222 aa  45.1  0.003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4926  hypothetical protein  23.47 
 
 
251 aa  45.1  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000829023 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3723  hypothetical protein  23.76 
 
 
211 aa  45.1  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0044  hypothetical protein  26.47 
 
 
227 aa  45.1  0.003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09311  conserved hypothetical protein  32.77 
 
 
258 aa  44.7  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.125843  normal  0.822415 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3722  hypothetical protein  24.14 
 
 
214 aa  44.7  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3861  hypothetical protein  26.13 
 
 
229 aa  43.5  0.008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.248681  unclonable  0.00000280431 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>