31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_1029 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013595  Sros_1029  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  462  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617928  normal  0.14633 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6098  hypothetical protein  42.08 
 
 
213 aa  187  9e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.014139  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4978  hypothetical protein  43.4 
 
 
215 aa  187  2e-46  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2286  hypothetical protein  47.17 
 
 
222 aa  180  1e-44  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.387299 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2182  hypothetical protein  41.2 
 
 
221 aa  177  1e-43  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.942905  normal  0.83113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2127  hypothetical protein  40.95 
 
 
208 aa  167  8e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0840601  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2687  hypothetical protein  38.14 
 
 
208 aa  166  2e-40  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0274676 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04341  hypothetical protein  42.44 
 
 
234 aa  166  2e-40  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7151  hypothetical protein  43.41 
 
 
231 aa  166  2.9999999999999998e-40  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0954  hypothetical protein  39.64 
 
 
219 aa  155  4e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0151297  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3722  hypothetical protein  36.67 
 
 
214 aa  152  2.9999999999999998e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0557  hypothetical protein  38.77 
 
 
240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5888  hypothetical protein  38.46 
 
 
241 aa  144  8.000000000000001e-34  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3723  hypothetical protein  37.14 
 
 
211 aa  142  4e-33  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00723  hypothetical protein  34.87 
 
 
285 aa  140  1.9999999999999998e-32  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0881472  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3924  hypothetical protein  38.79 
 
 
233 aa  133  1.9999999999999998e-30  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349522  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48406  predicted protein  31.14 
 
 
369 aa  108  5e-23  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.701766  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09311  conserved hypothetical protein  34.27 
 
 
258 aa  106  2e-22  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.125843  normal  0.822415 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3844  hypothetical protein  34.25 
 
 
524 aa  80.5  0.00000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0476944 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09208  conserved hypothetical protein  30.8 
 
 
295 aa  79  0.00000000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43516  predicted protein  30.33 
 
 
360 aa  78.6  0.00000000000007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.019532  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1097  hypothetical protein  26.25 
 
 
215 aa  75.5  0.0000000000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2445  hypothetical protein  25.12 
 
 
240 aa  72.8  0.000000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2393  hypothetical protein  25 
 
 
241 aa  70.9  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  24.88 
 
 
442 aa  60.1  0.00000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33199  predicted protein  29.44 
 
 
257 aa  59.7  0.00000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1833  hypothetical protein  28.02 
 
 
476 aa  58.9  0.00000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.424586  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0358  hypothetical protein  23.56 
 
 
305 aa  43.9  0.002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_34440  predicted protein  33.33 
 
 
391 aa  43.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0368  hypothetical protein  23.56 
 
 
323 aa  43.5  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000028153 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0365  hypothetical protein  23.85 
 
 
272 aa  42  0.008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>