24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48406 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_48406  predicted protein  100 
 
 
369 aa  770    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.701766  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1029  hypothetical protein  31.14 
 
 
225 aa  108  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.617928  normal  0.14633 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00723  hypothetical protein  33.47 
 
 
285 aa  105  1e-21  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0881472  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3722  hypothetical protein  30.43 
 
 
214 aa  100  4e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2182  hypothetical protein  31.44 
 
 
221 aa  100  6e-20  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.942905  normal  0.83113 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5888  hypothetical protein  31.03 
 
 
241 aa  95.5  1e-18  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.886605 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6098  hypothetical protein  28.96 
 
 
213 aa  95.5  1e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.014139  normal 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43516  predicted protein  29.27 
 
 
360 aa  94.7  2e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.019532  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2286  hypothetical protein  25.85 
 
 
222 aa  91.7  2e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.798269  normal  0.387299 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09208  conserved hypothetical protein  30.15 
 
 
295 aa  91.3  2e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4978  hypothetical protein  28 
 
 
215 aa  87  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.212732  normal  0.467407 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04341  hypothetical protein  28.05 
 
 
234 aa  85.9  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7151  hypothetical protein  30.41 
 
 
231 aa  82  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.910339  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3723  hypothetical protein  28.95 
 
 
211 aa  81.6  0.00000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2687  hypothetical protein  27.76 
 
 
208 aa  80.9  0.00000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0274676 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0557  hypothetical protein  28.82 
 
 
240 aa  80.5  0.00000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0954  hypothetical protein  28.02 
 
 
219 aa  79.7  0.00000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0151297  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2127  hypothetical protein  26.01 
 
 
208 aa  78.6  0.0000000000002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0840601  normal  0.0650777 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3924  hypothetical protein  24.55 
 
 
233 aa  75.9  0.000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.349522  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_09311  conserved hypothetical protein  27.56 
 
 
258 aa  67.8  0.0000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.125843  normal  0.822415 
 
 
-
 
NC_011671  PHATR_33199  predicted protein  25.1 
 
 
257 aa  63.9  0.000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2393  hypothetical protein  25.68 
 
 
241 aa  59.3  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2445  hypothetical protein  26.58 
 
 
240 aa  58.5  0.0000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.228049 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0022  tetratricopeptide TPR_2  23.73 
 
 
442 aa  53.1  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>